沙棘属共有7个种8个亚种，是广布类群。它的成员分布在从西边的斯堪的纳维亚半岛，欧洲，西亚，到喜马拉雅地区，黄土高原，直到亚洲东部华北的欧亚大陆广大地区。在东亚的中国沙棘经历了青藏高原的隆起，第四纪冰期与间冰期的反复和黄土化过程。其起源、演化及种群动态的研究对中国地区物种演化具有重要意义。本研究运用沙棘叶绿体非编码区变异序列trnL-trnF和trnS-trnG结合核基因ncpGS片段在中国沙棘的分布区范围内，考察了这个二倍体、风媒异交传粉植物的遗传多样性及种群结构、亲缘地理格局及扩散。　　 在沙棘属4个类群76条序列中，共发现14个单倍型，有36个变异位点，大多出现在种间。对单倍型建亲缘树显示，无皮组的两个类群（中国沙棘Hippophae rhamnoides ssp．sinensis和中亚沙棘Hippophae thamnoides ssp． turkestanica）与有皮组的肋果沙棘Hippophae neurocarpa分开聚在不同的支上，显示出明显的遗传分化；分支长度证据则暗示中国沙棘在沙棘属内的古老地位。　　 中国沙棘内部的叶绿体体现了较强的遗传结构，种群内部个体间以及种群间都存在显著的遗传分化（P<0．01），其中大部分分化发生在种群间（Fst=79．35）。在地理上，种群分化来源有两个方面：1）首先，来源于华北及黄土高原四个种群与西部青海四川类群之间的较大遗传距离。在两个类群中出现频率分别最高的两个单倍型之间不仅有11个单点突变，还有一段65bp的插入缺失。2）其次，来源于西部种群内部。在四川的4个种群内部存在中等到极显著的分化Fst>0．15（0．05为显著，0．05-0．15为中等分化），表明在横断山脉中北段到青藏高原东缘的这一地区沙棘叶绿体基因流受到强烈阻隔，而成片段化分布。这一较大的分化以及一些单倍型的种群特有性及重复间断分布的原因之一是冰期以及间冰期的反复出现。　　 四川红原发现了兼具两类叶绿体遗传物质特点的种群。既含有秦岭以北黄土高原种群古老单倍型的近缘类型，又含有位于单倍型网络另一个中心的横断山脉及青藏高原东缘古老单倍型。我们推测，四川红原以及若尔盖周边地区是这两类群体的接触地带，四川的红原和甲洼是冰期中国沙棘最有可能的避难所。