黄瓜HD-ZipⅠ类转录因子的生物信息学及功能分析

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黄瓜(Cucumis sativus L.)是我国主要的设施蔬菜。卷须是黄瓜重要的性状之一,在豆类的研究中表明,卷须是由HD-ZipⅠ类转录因子调控的。HD-Zip家族是植物中最大的几个家族之一。从低等的藓类植物到被子植物都有发现。HD-Zip家族的转录因子被分为了四个亚家族:HD-ZipⅠ—Ⅳ。首先,通过Blast搜索和系谱树分析,我们在黄瓜中找到了13个HD-ZipⅠ类的转录因子,通过系谱树分析将这13个转录因子分成了α,β1, β2, ε, γ和δ6个分支。从HD-ZipⅠ类转录因子在染色体上的位置可以看出,这些基因不均匀的分布在7条染色体中的5条,染色体位置以及系谱树的共同分析可以发现,黄瓜HD-ZipⅠ类转录因子缺少片段复制以及串联复制。组织特异性分析实验显示出这13个基因最少都能在一个植物器官中被检测到,表明了黄瓜的HD-ZipⅠ类转录因子参与了许多细胞进程,并且相同分支内的基因表达位置相似。不同非生物胁迫实验发现13个HD-ZipⅠ类转录因子中的7个响应了一个或者多个胁迫,且ε, γ和δ三个分支中的基因对非生物胁迫更为敏感。总之,一些HD-ZipⅠ类转录因子表现出相似的细胞进程,尽管它们在不同的器官或组织中表达,并且响应不同的环境信号。为了进一步验证HD-ZipⅠ类转录因子的功能,我们构建了13个黄瓜HD-ZipⅠ类转录因子中的5个基因的过表达与沉默载体,并用其侵染黄瓜子叶节。遗憾的是,所得到的转基因植株没有明显的表型。
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