近年来，在民营企业组织形式中，有限责任公司的比重逐年增加并占据主导地位，民营股份公司的数量也多了起来，公司制己经成为中国民营企业的现实选择。世界各国的企业发展历史以及中国的实践都证明：实现委托代理制，走向现代企业制度，是稍具规模的民营企业的必由之路。企业中委托代理关系的产生，导致了治理结构问题的出现。 我国的《公司法》对公司治理结构作了较为全面的规定，但是由于受各种因素的影响，《公司法》对治理结构的设计还有不尽完善的地方，加上民营企业的自身影响因素，许多民营企业的治理结构还存在一些重大的问题。这些问题不解决，企业的活动就会受到制约，发展就会受到限制。因此，改革企业治理结构成为当前众多民营企业的重要任务之一。本文通过案例分析对中国民营企业治理结构现状进行研究，将民营企业的治理结构问题归结为三个方面：产权问题、代理问题、董事会构成问题。在理论研究的基础上，借鉴国际公司治理经验提出对中国民营企业内部治理的一些改进意见，希望本文能够对我国民营企业治理结构调整有所裨益。 本文的主要内容和逻辑结构是：第一，问题提出的背景、问题特征界定；第二，研究的理论基础；第三，民营企业治理结构的现状和分析，包括对民营企业产权性质分析及存在的问题、民营企业委托代理关系实施现状、民营企业董事会功能与结构分析：第四，从几个方面提出对我国民营企业公司治理结构的改进意见;第五，对一家民营企业一九州药业公司的公司治理结构进行了深入剖析，并在此基础上就该公司的公司治理结构现状给出了改进建议。