农民专业合作社作为一种新型的合作经济组织，在提高农民组织化程度、带动农民增收、发展现代农业、建设社会主义新农村进程中发挥了积极作用，显现出旺盛的生命力和广泛的适用性。农民专业合作社在临安出现十年来，已在临安市农业和农村经济中发挥了重要作用。本文通过对临安市农民专业合作社发展现状、存在问题和运行机制的深入的分析，得出以下结论和建议：（1）临安市农民专业合作社起步晚，但是发展迅速。合作社组建方式灵活、涉及产业全面、规范化水平不断提高。在提高农民组织化水平，增加农民收入，促进农业产业结构调整，促进农业科技成果转化，强化农业社会化服务体系建设方面发挥了重要的作用，并取得显著的效果。（2）目前，临安市农民专业合作社以农产品基础生产为主，缺乏对农产品的深加工。同时，也面临着规模不大、辐射能力不强、内部运作不规范、主体地位不明显等问题。（3）临安市农民专业合作社运行机构构建应包括以下方面：完善组织机构机制；建立灵活多样的运营管理机制；强化服务引导机制、不断完善利益共享机制、建立风险承担机制。