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黑棘鲷是海水养殖中的优良品种,具有极高的经济价值。在经历了过度捕捞与环境污染等问题后,其种质资源有着一定程度的衰退。虽然增殖放流等项目的陆续开展对黑棘鲷种质资源恢复有一定的促进作用,取得了较好的经济与生态效益,但是在一定程度上也改变了该物种的遗传多样性与遗传分化。本研究利用FIASCO的方法开发和筛选了黑棘鲷的微卫星多态位点,并利用筛选出来的多态位点对我国沿海10个野生黑棘鲷群体进行遗传多样性与遗传结构的研究,填补了国内关于大范围内黑棘鲷种群遗传学研究的空白。具体研究结果如下:利用FIASCO法富集黑棘鲷的微卫星DNA序列。从获得的阳性克隆中随机挑选180个进行测序,获得157条含有STRs的DNA序列,设计引物72对并在漳浦群体的30个野生个体中进行扩增检测。结果进行分析处理后获得17对多态性引物,12对单态性引物。这17对多态引物的等位基因数为2-5,平均值为3.3529。多态信息含量的均值为0.5133,范围在0.2280-0.7320之间波动。观测杂合度和期望杂合度分别在0.0952-0.8966和0.1823-0.7407之间,且平均值分别是0.5239与0.4944。从17个多态性的微卫星位点中优选9个来检测我国沿海10个黑棘鲷群体的遗传多样性与遗传分化。结果表明,黑棘鲷10个群体的PIC的均值为0.5143,变化范围在0.4433到0.5804之间;平均每位点等位基因数(A)从3.0000到3.4444之间不等,平均数值为3.2333,总体值为3.6667;平均每位点的有效等位基因(Ae)数值在2.0130到2.6014范围内,平均值是2.2994,总体值为2.8013;同理,观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)的变化范围分别是0.4607-0.5789和0.4657-0.5967,平均值为0.5278和0.5183,总体值则分别为0.5261和0.6224。固定指数Fis数值为-0.0371,表明了10个群体整体呈现出杂合子过剩的状况,结合A、Ae与PIC表明了我国沿海这10个黑棘鲷的遗传多样性处于中等水平,且低于国外群体的遗传多样性水平。遗传分化结果中总群体固定指数Fit表明整个群体间存在着近交现象。Fst结果显示整个黑棘鲷群体分化极大,多数变异来自于群体内部;遗传距离与UPMGA图呈现出南北类群之间分化的格局,且在南方类群中的各群体分化结构不显著,与其地理分布不一致,受到人为干扰的可能性高。通过对我国沿海10个群体的黑棘鲷种群遗传进行研究,对实际生产中黑棘鲷的养殖育苗、种质改良等有着重要的指导意义。