安徽部分地区鹅星状病毒遗传进化分析及检测方法建立

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangjun3812
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
2015年以来,我国出现了一种由鹅源星状病毒(goose astrovirus,GAst V)导致的以病鹅关节和内脏器官尿酸盐沉积为典型症状的疾病,给养鹅业造成严重经济损失。目前针对该病尚无非常有效的治疗措施及疫苗,防治重点在于疫情的早期诊断和监控。因此本研究从分析安徽省部分地区GAst V的遗传多样性和建立快速检测方法两方面开展了试验,为GAst V的流行病学调查和早期诊断提供了技术支持。为了更好地了解安徽地区GAst V流行情况,本研究以32份来自安徽部分地区的具有痛风症状的雏鹅肝脏和肾脏临床组织为样品象,RT-PCR检测出6份GAst V阳性样品。设计14对特异性引物,PCR扩增其中5株GAst V全基因序列,命名为AHAU1、AHAU2、AHAU3、AHAU4、AHAU5,提交至Gen Bank,并进行核苷酸相似性和遗传进化分析。结果显示,扩增的5株GAst V与GAst V参考毒株之间的相似性为97.4%-99.2%,与SDPY株的核苷酸序列相似性最高,达到99%。遗传进化分析结果显示,AHAU1和AHAU4与参考毒株SDPY(MH052598)在同一分支,有较高的亲缘关系;AHAU2、AHAU3和AHAU5形成了单独的分支。为快速、准确地诊断GAst V,本研究针对GAst V ORF2基因保守区域设计引物,通过优化反应条件和体系,建立了SYBR Green荧光定量RT-PCR和RT-LAMP两种检测方法。SYBR Green荧光定量RT-PCR试验结果显示,除GAst V外,禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)、血清4型禽腺病毒(Fowl adenovirus serotype 4,FAd V-4)、鸡传染性喉气管炎病毒(Avian Infectious Laryngotracheitis virus,ILTV)、鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)和传染性支气管炎(Avian infectious bronchitis virus,IBV)等利用该方法检测均呈阴性,特异性高;最低检测限为37.5拷贝/μL,敏感性是普通RT-PCR的100倍;组内组间变异系数均小于1%,重复性良好。利用该方法对32份临床样品进行检测,阳性检出率比常规RT-PCR高25%,两种方法检测的阳性符合率为42.85%,表明该方法可用于临床样品的检测?RT-LAMP试验结果显示,60℃条件下水浴60min便可完成检测;与FAd V-4、ILTV、ALV、GPV和IBV等病毒无交叉反应;敏感性与巢式RT-PCR相当;对32份病鹅肝脏和肾脏临床样本进行了检测,RT-LAMP阳性检出率比巢式RT-PCR高9.33%。综上所述,本研究对安徽部分地区GAst V进行了遗传进化分析,同时建立了两种快速检测方法。将有助于更好地了解安徽地区GAst V的遗传进化情况,同时丰富了GAst V数据支撑,也为GAst V的快速诊断奠定了一定的基础。
其他文献
保护与发展,是传统村落永恒的主题。北镇市坐拥医巫闾山山脉,在医巫闾山文化和地理环境双重因素下,当地聚落呈现出独特的地域文化。然而,随着城镇化进程的加快,闾山传统村落风貌不断被破坏,与此同时,村落多分布在贫困地区,甚至还未摆脱贫困村的称号,对其如何保护与发展是需要研究的重要问题。本文以闾山传统村落的5个典型传统村落为研究对象,运用城乡规划学、建筑学等专业知识,并结合人文地理学、景观学、生态学相关方面
电力核算作为电力运营及营销管理的一个重要组成部分,也是当前在整个电力运营和营销管理信息化中的一个核心内容,以电力核算数据为基础的开展各项电力运营及营销的工作是未来进一步提高电力运营及营销管理服务的关键,从而为用户提供更加优质的服务。随着智能电网的全面建设,目前各种信息已经处于一个升级利用的阶段,特别是远程抄表系统的应用,使得在核算方面进行智能化的处理成为了可能。在这一背景下,本文以山东电力公司的电
油田射孔工序作为石油工序中较为关键的工序之一,其职工的技能培训也尤为重要,为此油田也开发出了一些用于岗前培训的仿真系统。但由于仿真培训系统中通过鼠标与键盘进行交互的方式存在着现场感缺乏以及用户体验不足等缺点,因此需要对仿真培训系统进行改进。为解决上述问题,通过对情境学习、情境创设的基本要求和基本原则进行总结归纳,再对射孔工人的学习特征及学习需求进行分析,研究射孔仿真培训系统如何在情境学习理论的指导
2018年新修订的《刑事诉讼法》确立了刑事缺席审判制度。它在适用范围上将贪污贿赂犯罪纳入其中,此举既是增设该制度的主要目的,也是刑事缺席审判制度中的亮点。对内而言,它
在社会经济不断发展的大环境下,社会贫富差距明显扩大,不管是高职院校数量还是培养人数都呈现出不断增加的发展态势,其体量、规模和普通本科院校的差距也在明显缩小。因为高职院校生源很多都来源于一些偏远山区、农村和教育背景不好的家庭,这就使得与本科和重点院校相比,贫困生的比例更大,贫困程度更高,并且相比于本科学生,高职学生的能力更差,文化素养也更低,二者在培养目的和方式上还存在诸多差异。目前,国外学者对资助
大花君子兰(Clivia miniata)是兼具药用和观赏价值的“十大年宵花卉”之一。彩叶君子兰(Clivia miniata var.variegata,彩兰)是大花君子兰的突变体,其典型植株具备黄绿相间条纹叶。彩兰条纹表型呈母系遗传,条纹叶形成机理有待研究。本研究采用高通量叶绿体基因组测序、高通量转录组测序、PCR、一代测序和生物信息学分析的方法揭示条纹表型形成机理。主要结果如下:(1)通过高
权质押融资自2015年以来开始在我国资本市场盛行,由于股权质押拥有门槛低、快捷、便利等特征,目前已经成为上市公司股东最重要的融资方式之一。随着控股股东股权质押的数量和比例不断上升,由股权质押所导致的风险也逐渐暴露出来,股权质押会导致“两权分离”的情况出现,从而引发委托代理问题。一些动机不纯的控股股东为了获取私利,就会先将股份质押变现,然后利用手里不变的控制权做出一些侵害中小股东利益的行为,最终“掏
地源热泵技术是一种环保节能技术,它是利用的可再生能源。当今社会实际工程利用的非常广泛,地质条件对地源热泵的运行有较大的影响。长春市属于严寒地区,地源热泵系统冬季从土壤中取出的热量大于夏季向土壤中输入的热量,这样就会造成地下土壤温度的降低,随着长时间的运行土壤温度会逐年降低,土壤温度的降低会直接影响地源热泵系统的工作效率。埋管间距是影响热泵机组运行效率的一个直接因素,一个合适的埋管间距,对热泵机组运
本文主要讨论了气动弹性系统的稳定性与分岔、分片光滑系统的极限环与局部临界周期等问题,共由如下四部分组成。第一章,论述了以上两类问题的研究现状与进展,并介绍了每个章节研究的具体内容。第二章,分析了一类二元机翼气动弹性系统退化平衡点处的稳定性与分岔。并通过数值模拟,验证了理论分析的合理性。第三章,研究一类四次分片光滑Riccati系统的极限环与临界周期分支问题。证明该系统在原点邻域内最多有10个极限环
玛丽莲·罗宾逊是美国当代著名作家,具有强烈的人文主义关怀精神。处女作《管家》以一对孤女露丝和露西尔为切入点,通过书写女性挣脱困境的努力,展现了美国社会中试图脱离传统、打破规则的女性的生存境遇。本论文旨在分析《管家》中女性人物的身体在推动叙事、塑造人物、强化主题中的表现,展示女性身体在叙事中的作用。结合身体理论和创伤理论,分析作者是如何通过叙述女性身体来展现她们的伤痛,伤痛下生长出的女性自我身份,以