【摘 要】
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采用不经培养的rRNA方法,对1999年采集的南极菲尔德斯半岛地区长城站附近的6份表层土壤样品、2001年采集自不同站位不同深度的52份南极海水样品以及2002年北极加拿大海盆不同
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采用不经培养的rRNA方法,对1999年采集的南极菲尔德斯半岛地区长城站附近的6份表层土壤样品、2001年采集自不同站位不同深度的52份南极海水样品以及2002年北极加拿大海盆不同站位不同深度的59份海水样品和冰站卤水、潜水等9份样品中的细菌群落系统进化组成进行分析.通过PCR结合变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对从土壤样品中获得16SrRNA基因特征片段V3区序列进行分离.对南北极同一站位不同深度海水样品进行分析,发现在DGGE指纹图谱上电泳分离条带的组成和分布不完全相同,推测随着海水深度的变化,海水中的细菌组成可能发生变化.从极地海洋不同深度海水样品中获得序列常常同数据库中来自海洋环境尤其是极地海洋环境中的培养或未培养细菌16SrDNA序列或克隆序列具有较高相似性.从南北极海水样品中获得序列可归类为proteobacteria分类群、CFB群和G<+>细菌,其中以属于α、γ-proteobacteria分类群和CFB群的序列为主.从北极海冰样品中获得的序列与α、β、γ-proterobacteria分类群、CFB群和G<+>细菌的序列具有较高的相似性(90﹪~100﹪),其中α、γ-proterobacteria分类群和CFB群占优势.这同海冰下面的海水中的细菌组成相似.另外,对北极海水、海冰样品经过培养和不经培养获得的16SrRNA基因特征片段V3区序列进行分离比较,结果表明不经培养方法获得的DGGE条较多,更能真实反映自然环境样品中细菌的组成和分布.
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