长期以来,我国高校重大财政专项资金绩效评估受制于方法论欠缺,在实践中推进缓慢,实施效果不佳。当前正在推进的“双一流”建设工程,中央及地方财政投入的专项建设经费力度空前,但在落实“强化绩效、动态支持”这一实施原则方面依然存在差距:一方面,专业性学科评估方案未能将财政经费投入情况纳入评估视野;另一方面,会计师事务所等经济领域第三方机构依循的专业评估标准含糊笼统,专业胜任能力亦有较大差距。为此,研究聚焦江西省一流学科财政专项资金绩效评价,不仅能为高校重大财政专项资金绩效评估作出积极理论贡献,而且可以通过适切的方法论构建,推动高校“双一流”建设专项经费绩效评估工作开展,提高资金使用效益。研究主要内容如下:（1）追溯了江西省一流学科建设起源,研究了一流学科的发展历程。从省重点学科建设、省一流学科建设工程两个阶段梳理江西省高水平学科发展过程,分层次比较分析江西省高校办学经费转化为教学与学科建设领域的资源配置情况,为后文提供现实基础。（2）构建了科学的一流学科财政专项资金绩效评价体系,引入超效率SBM-DEA模型展开实证研究。首先,梳理一流学科建设、高校重大财政专项资金两方面的绩效评价理论,剖析U.S.News,QS,THE,ESI和ARWU等国内外主流学科排名体系,分析高等教育领域公共财政资金绩效评价、学科评估等方面文献及实践;其次,基于“投入--产出”分析框架,结合江西省经济社会发展情况及学科水平现状构建可量化的财政专项资金绩效评价体系,设计财政支出、师资力量和基地支撑为投入一级指标,育人成果和科研成果为产出一级指标,测度了江西省一流学科财政专项资金绩效。最后,研究探究了一流学科财政专项资金绩效提升路径。依托DEA两阶段柔性协调组合模型,将学科建设动态系统分解为资金配置和学科内涵发展两个相互衔接的子系统,并结合江西省一流学科建设指标数据进行实证分析,从资金配置和学科内涵发展两维度设计了提升一流学科财政专项资金绩效路径,给出了改善一流学科财政专项资金绩效的对策建议。