茎蜂科Cephidae隶属于膜翅目Hymenoptera广腰亚目Symphyta,目前全世界已知有25属170种。很多茎蜂都是植食性害虫,因此研究茎蜂的系统发生关系有重要理论意义和实践价值。茎蜂科传统形态分类学研究虽已基本完成,但目前已有的分子数据较少,其系统发育关系尚未得到很好的解决。本研究采用二代测序法对7属8种茎蜂的线粒体基因组以及8个单拷贝核基因进行了测序,分别结合NCBI上已发表的13种茎蜂的线粒体基因组数据和10种茎蜂的单拷贝核基因数据进行了系统发育关系研究。同时,选取这13种已发表茎蜂科线粒体基因组数据及实验室所测2条茎蜂科线粒体基因组代表数据,对其rRNA二级结构进行预测,对其茎环进行拆分并进行了进一步的分析,所得主要结果如下:1、所测8种茎蜂线粒体基因组长度在15 468bp到17 11 1bp之间,均包含13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因,基因组的A+T含量在75.2%到83.3%之间,基因重叠在部分位置较为稳定,但基因间隔的差异较大。蛋白质编码基因的A+T含量在72.6%到80.9%之间,除Megajanus megamaculatus和Neosyrista incisa的ATP8起始密码子为 TTG、M megamaculatus 的ND4起始密码子为GTG外,其他所有蛋白质编码基因起始密码子均为标准的ATN形式,所有种类的蛋白质编码基因终止密码子均为TAA或TAG,蛋白质编码基因的密码子使用频率和核苷酸组成之间存在显著相关性。所有tRNA基因均可以形成三叶草二级结构。所有种类均发生了基因重排,多数种类的重排发生在rrnS和ND2之间。茎蜂科的rrnS的基因长度从958bp到1312bp不等,rrnL基因长度从1362bp到1619bp不等。2、通过比较研究法,参考已发表数据预测了茎蜂科rRNA基因的二级结构,并绘制了二级结构图,其中茎蜂科rrnS基因的二级结构与其他广腰亚目种类相比多出H61和H821两条茎。对二级结构的茎环进行了拆分,对拆分出来的每条茎进行了保守程度分析,绘制LOGO图,逐一对每条茎的异同点进行了分析,结果表明,在rrnS基因中,保守程度较高的茎多集中在Ⅲ区,在rrnL基因中,保守程度较高的茎多集中在Ⅳ、Ⅴ区,而保守程度较低的茎多为拥有发夹环且碱基个数差异较大的茎。3、本研究使用了包括PCGs数据集、茎环拆分数据集和单拷贝核基因数据集等多个数据集对茎蜂科系统发育关系进行了研究。结果表明,传统分类学将茎蜂科分为茎蜂亚科和等节茎蜂亚科两大支系的分类系统得到了分子系统学的支持;但线粒体基因组数据集的系统树不支持Characopygus与Pachycephus的姊妹群关系,因此宽颜茎蜂族的单系性未得到支持,其中Characopygus是茎蜂亚科的成员,Pachycephus属是等节茎蜂亚科的成员,与Characopygus关系较远;Neosyristaincisa目前在传统分类学中被归入Syrista属,但所有数据集的系统树均不支持Syrista的单系性,Neosyrista属应该恢复;等节茎蜂亚科内传统分类学建立的简脉茎蜂族的单系性未得到支持,等节茎蜂亚科内的族级划分还有待进一步研究。