基于LXRα结构的药物设计以及几种非键相互作用的理论研究

来源 :中国科学院上海药物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhensa9d
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本文以LXRβ-LBD的晶体结构为模板,用同源模建的方法构建了LXRα-LBD的三维结构。然后,用分子对接程序DOCK4.0对SPECS数据库进行虚拟筛选,选取打分在前10000名的分子做进一步的分析评价;最后从中挑选了66个化合物,购买后进行生物测试。 本文采用量子化学计算方法开展了如下的工作。用B3LYP和MP2方法,以N-甲基甲酰氨-苯体系为模型,首次研究了肽键NH…π氢键作用。发现色散作用与静电作用对N-甲基甲酰氨与苯的结合起到重要作用,而二者间的轨道相互作用较弱。 本文分别以甲烷、苯和乙炔代表sp3、sp2和sp三种不同杂化状态的氢键供体;以氨、吡啶和腈分别代表sp3、sp2和sp三种不同杂化状态的氢键受体。共组成9种C-H…N氢键复合物进行高精度的从头算研究。用B3LYP方法和MP2方法对四甲基铵-(苯)n(n=3,4)体系的结构和能量的特点进行探讨。结果表明色散作用对四甲基铵与苯的结合十分重要。 本文结合以前对四甲基铵-苯和四甲基铵-(苯)2体系的研究,我们发现四甲基铵-(苯)n(n=1-4)体系的结构和能量性质具有加合性。用GIAO方法计算了形成复合物前后各原子的NMR化学位移。揭示了由阳离子-π结合引起的各原子化学位移变化与阳离子和芳环取代基的性质密切相关性。
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