云南地区常见食用菌DNA条形码分析

来源 :云南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gjb649666926
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
云南省具有得天独厚的大型野生食用菌资源,本研究采集了云南省范围内31个地区及四川省理塘县、雅江县、康定县和乡城县的4532份野生食用菌标本。用ITS作为云南地区野生食用菌鉴定和分类的分子标记基因,大范围地调查了云南地区野生食用菌数目、食用菌种内和种间距离等,评估了ITS作为云南地区野生食用菌DNA条形码的可行性,为云南地区野生食用菌的保护和利用提供理论依据。此外,为探究了Trogia venenata(小白菌)导致的不明原因死亡(SUD)的致死因子,对Trogia venenata进行了钡含量的检测和群体遗传学分析。  目前取得了如下结果:  1、调查了4532份野生食用菌标本,涵盖了云南省12个州市31个县(乡)以及四川省与云南省邻近的理塘县、雅江县、康定县和乡城县4个县城,跨越了温带、亚热带及热带三种气候类型。根据标本的形态学特征和当地的俗名,初步估计标本里面包含了41个物种。  2、用ITS作为云南地区野生食用菌鉴定和分类的分予标记基因,大范围地调查云南地区野生食用菌数目,在4532余份标本里面挑选了2849份用CTAB法提取了基因组DNA,成功得到2256份可用的基因组DNA,PCR扩增得到ITS序列2207条,剪切校正后得到序列2020条(≥200bp),在NCBI里进行Blast后,序列覆盖率达到80%以上并可确定种名的有效序列为1790条。  3、根据GenBank Blast的最大相似度结果,我们将1790条ITS序列的比对结果分为≦95%-97%、≥90%-95%、<90%四个区间,以最大相似度≥97%为标准,物种数目为73个,而以≦95%-97%、≥90%-95%、<90%为标准,则分别增加10、27和12个新物种,总计122个物种,分予鉴定的物种数较之形态种数目大幅上升。  4、选择了Amanita、Boletus、Ramaria、Russula和Thelephora五个属的常见物种构建了NJ树,发现在鉴定的物种中存在着许多系统发育种(隐存种)。  5、分别计算了各个物种内、种间的遗传距离,结果显示K2P值在不同种属间有差异,大部分种间的K2P值都大于种内的。结合PCR扩增效率及测序片段出现杂合的频率,认为ITS作为云南地区大多数野生食用菌的DNA条形码基因是可行的。  6、探究了小白菌(Trogia venenata)导致的不明原因死亡(SUD)的致死因子,对云南省不明原因死亡高发地区的Trogia venenata样本进行了钡含量的检测和群体遗传学分析,钡含量检测结果证明钡含量不是导致不明原因死亡(SUD)的关键因子,群体遗传学分析结果表明不明原因死亡(SUD)与不同地区的Trogiavenenata种群的遗传变异没有直接联系。
其他文献
通信网的迅速发展、多媒体的广泛应用,使得对于通信系统的速率要求越来越高。光纤通信具有诸多优点,成为现代通信中极其重要的通信方式。复接器位于光纤通信系统中发射机的最前
目的 探讨流式细胞学检测儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中枢神经系统浸润阳性(CNSI+)患者的临床特征及其与预后的关系.方法 回顾性收集2008年4月至2013年6月CNSI+ALL患儿66例
为保障煤矿的安全生产和井下人员的生命安全,开发可随身携带的瓦斯传感器对瓦斯进行实时检测十分必要。MEMS(Micro-Electro-Mechanical Systems )即微机电系统,是一种把现代集成
学位
本文通过对荣华二采区10
期刊
初春齐聚Tweed Run大Party,夏天夜跑2KM,深秋滑翔在U池里,到了冬天呢?冷空气让冬天找乐子的想法也呈直线下降趋势,除了窝在被子里握着Xbox手柄、跟围坐一桌的狐朋狗友火锅涮
决策自古有之,决策问题可以分为单目标决策和多目标决策。多目标决策是指决策所要达到的目标有多个,且这些目标是互相联系又互相制约的决策。这类决策要求用系统的观点,对希
血管生成对于肿瘤的生成、生长和转移是至关重要的,而血管生成主要是受促血管生成因子和抑血管生成因子的调控,endostatin和VEGF165是活性最强的抑血管生成因子和促血管生成因
通常,多光谱和高光谱遥感图像是以像元为单位来检测和获取地物信息。由于遥感图像空间分辨率的限制,一个像元往往覆盖几十甚至几百平方米的地面范围,在其中可能包含着多种地物类型,这就形成了混合像元。混合像元问题不仅影响地物的识别和分类精度,而且是遥感技术向定量化发展的重要障碍。如果通过一定方法,找出组成混合像元的各种地物种类的比例,则可解决混合像元问题,提高定性和定量遥感精度。混合像元的精确分解在基于多光
本文通过对荣华二采区10
期刊