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体细胞重编程是将终末分化的细胞重新恢复到去分化状态的过程。体细胞核移植技术和转录因子介导的重编程技术是应用最广泛的两种体细胞重编程方法。通过这两种技术得到的完全重编程的核移植胚胎干细胞(nuclear transfer embryonic stem cells，ntESCs)和诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cells，iPSCs)在再生医学中均具有潜在的应用价值。 在本研究中，我们利用二次重编程系统，获得了与核移植胚胎干细胞遗传背景严格一致的诱导性多能干细胞，避免了转录因子介导的重编程过程中外源基因随机插入和整合到体细胞基因组的影响。应用表观遗传特性分析、基因表达分析以及高通量测序的方法，对核移植胚胎干细胞与诱导性多能干细胞进行重编程研究。实验结果显示Zrsr1的甲基化水平可以帮助预测核移植胚胎干细胞和诱导性多能干细胞的多能性。Dlk1-Dio3区域相关基因的表达水平仅和诱导性多能干细胞的多能性相关。核移植胚胎干细胞和诱导性多能干细胞在DNA甲基化、羟甲基化修饰和转录组表达水平上具有相似特性，并首次发现印记基因Grb10与核移植胚胎干细胞的多能性相关。 总之，在本研究中我们建立了遗传背景严格一致的核移植胚胎干细胞系和诱导性多能干细胞系，发现评价诱导性多能干细胞多能性的体系并不完全适用于核移植胚胎干细胞，还首次发现了Grb10与核移植胚胎干细胞的多能性相关。本研究为阐明体细胞核移植技术和诱导多能干细胞技术的重编程机制打下了基础，并为核移植胚胎干细胞和诱导性多能性干细胞在再生医学上的应用提供了理论依据。