CCL18介导的非小细胞肺癌细胞磷酸化谱的蛋白质组学分析

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肿瘤微环境调节肿瘤的生长、侵袭和转移。肿瘤相关巨噬细胞(TAM)在多种肿瘤中广泛存在,是肿瘤微环境的重要组成部分。TAM对肿瘤组织的浸润与多种恶性肿瘤患者的不良预后存在关联。TAM来源于血液单核细胞,它们被细胞因子和趋化因子诱导分化。趋化因子CCL18由M2型TAM分泌。在乳腺癌中,CCL18能与其受体PITPNM3作用和粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(CM-CSF)共同招募TAM,形成正反馈,促进肿瘤转移。CCL18在多种恶性肿瘤中异常表达,可作为其早期筛查指标和预后标志物。但是CCL18介导非小细胞肺癌进展的机制仍然缺乏深入研究。本研究以非小细胞肺癌细胞系A549为载体,从表观遗传修饰的角度,通过稳定同位素标记氨基酸细胞培养(SILAC)技术,联合液相色谱串联质谱(LC-MS/MS),结合生物信息学方法,分析CCL18介导的磷酸化蛋白质组。我们鉴定出了3904个蛋白质及其11628个磷酸化位点,对其中2408个蛋白质中的7582个磷酸化位点进行定量分析,当定量比大于2或小于0.5的蛋白质被认为是有显著变化的。与对照组相比,在定量的蛋白质中,412种蛋白质中的603个磷酸化位点被上调,而263种蛋白质中的334个磷酸化位点被下调。分析结果显示磷酸化修饰广泛发生在细胞核、细胞质、和质膜,进一步分析发现,高度的磷酸化修饰与细胞生长、生物调节、细胞及蛋白代谢等众多生物过程密切相关。且这些磷酸化蛋白质参与了多条涉及肿瘤进展的信号通路,如m TOR通路、RNA转运相关通路、VEGF信号通路、黏着斑激酶信号通路与黏附连接信号通路等,这些通路均与肿瘤的发生发展密切相关,因此我们推测CCL18介导的蛋白质磷酸化修饰可能是介导非小细胞肺癌发生发展的重要因素之一,这为我们后期深入研究其机制奠定了理论基础。
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