2001年8月16日,中国证监会颁布了《关于在我国上市公司建立独立董事制度的指导意见》,这标志着独立董事制度在我国正式实施。引入独立董事制度的主要目的是充分利用独立董事独立公正判断的优势,避免中小股东的权益受到损害,维护公司的整体利益,最终解决我国上市公司存在的“一股独大”和“内部人控制”问题。然而根据近几年独立董事制度的实施情况来看,公司会计信息失真,盈余管理现象十分严重,独立董事制度未能充分发挥其应有的作用,独立董事常被冠以“花瓶”的称号,独立董事的地位也受到严重挑战。独立董事制度是公司治理的重要组成部分,审计是公司外部治理的重要保障。因此,研究独立董事制度要素与审计意见的关系,为提高我国公司治理水平提供经验证据和理论支持,对改进和完善我国独立董事制度,具有重要的理论意义和现实意义。本文从注册会计师出具审计意见的角度出发,选取2007、2008年度沪、深两市上市公司的年报数据,以被出具审计意见的2118家上市公司为研究样本,通过Logistic回归分析方法验证独立董事比例、年度薪酬与上市公司被出具审计意见类型的关系,对独立董事制度进行理论分析和实证检验。研究得出:独立董事比例、年度薪酬与审计意见之间显著负相关。独立董事比例越高,公司收到标准无保留审计意见的可能性越大;独立董事年度薪酬对标准无保留审计意见有显著的影响。独立董事制度对于我国上市公司治理结构的完善,会计信息质量的提高做出了重大贡献。通过从审计意见的角度考察独立董事比例、年度薪酬对公司治理的影响,丰富了对独立董事制度的研究。只有在不断完善独立董事制度的同时,积极进行公司治理结构的改革,独立董事制度在我国才能发挥应有的积极作用。