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小麦赤霉病(Wheat head scab)是中国乃至世界小麦生产上的重要病害之一,本文以安徽省小麦产区所采集的小麦赤霉病菌为研究对象,着重从不同地区菌株菌群类型F. asiaticum和F. graninearum PCR-RFLP分子鉴定;菌群类型与前茬作物之间的关系;不同地区菌株产生毒素类型;探讨RealTime-PCR定量检测小麦赤霉病菌含量方法;主要研究结果如下:1.安徽省小麦产区赤霉菌株的PCR-RFLP分子鉴定及分布图绘制本文对2010-2013年期间采自安徽省小麦产区31个小麦赤霉病病穗进行了小麦赤霉病菌株分离纯化,同时对所有样品进行了DNA的提取[1]。样品分别来源于安徽北部地区:固镇、利辛、亳州市、毛集、凤台县、颍上县、阜阳市、蒙城县、太和县、涡阳县、怀远县、宿州市、砀山县;安徽中部地区:巢湖市、定远县、六安市、寿县、金寨县、霍邱县、长丰县、明光市、含山县、凤阳;安徽南部地区:宣州区、铜陵市、潜山县、怀宁县、安庆市、南陵县、繁昌县、芜湖市。利用引物进行PCR扩增,最后利用限制性内切酶Ecoi V和Sty Ⅰ对PCR产物进行酶切。结果显示:在所有31株小麦赤霉菌株中,只有寿县、砀山、蒙城、安庆菌株为F. graninearum,剩余27地菌株均为F. asiaticum。表明安徽省菌群类型以F. asiaticum为主,同时也有F. graninearum,但F. graninearum主要分布在皖北部地区。2.小麦赤霉病菌种群类型与前茬作物旱作水作(水稻、玉米)关系本试验采用大样本采样,前茬作物玉米的采样点:蒙城县、颍上十里铺、颍上西三十里铺、颍上六十里铺;前茬作物水稻的采样点:怀远县、颍上县。各采样点均分离、纯化30个小麦赤霉菌菌株,共180个菌株。利用特异性引物进行PCR扩增,最后用限制性内切酶Ecoi V和Sty Ⅰ对PCR产物进行酶切。结果显示:前茬作物为玉米的四个采样点,分离的120个小麦赤霉菌菌株中出现17株F. graninearum,剩余全部为F. asiaticum。F. graninearum菌株的检出率为14.2%;前茬作物为水稻的两个采样点,分离的60个小麦赤霉菌菌株中出现3株F.graninearum,剩余全部为F. asiaticum。F. graninearum菌株的检出率仅为3.3%。从试验结果可以看出,在相似生态区域内,前茬作物对小麦赤霉菌菌群分布有较大影响,前茬作物为玉米的F. graninearum检出率较高。3.安徽省小麦产区小麦赤霉产单端孢霉烯族毒素类型分三种,NIV、DON(3-DON、15-DON)PCR-RFLP分子鉴定本文对2010-2013年期间采自安徽省小麦产区31个小麦赤霉病病穗进行了小麦赤霉病菌株分离纯化,同时对所有样品进行了DNA的提取。利用引物对1:上游ToxP1(5’-GCCGTGGGRTAAAAGTCAAA-3’)下游ToxP2(5’-TGACAAGTCCGGTCGCACTAGC-3’)该引物对以小麦赤霉病菌DNA为模板进行PCR扩增,得到相应产物片段大小为360bp可判断该菌株产生毒素类型为NIV.片段大小为300bp可判断该菌株产生毒素类型为DON。具体为3-DON还是15-DON利用引物2,3分别判断。引物对2上游Tri303F(5’-GATGGCCGCAAGTGGA-3’)下游Tri303R(5’-GCCGGACTGCCCTATTG-3’)引物对3上游Tri315F(5’-CTCGCTGAAGTTGGACGTAA-3’)下游Tri315R(5’-GTCTATGCTCTCAACGGACAAC-3’)利用引物对2,3分别对小麦赤霉病菌DNA进行PCR扩增,只能扩增出586bp大小片段的菌株可判断该菌株产生毒素类型为3-DON,只能扩增出864bp大小片段的菌株可判断产生毒素类型为15-DON。结果表明:芜湖,潜山县,巢湖市,霍邱县,太和县,铜陵地区菌株样品产毒素类型为NIV,蒙城县,砀山县,寿县,安庆菌株产毒素类型为15-DON,剩余各县样品产毒类型均为3-DON。发现凡产毒素类型为15-DON的菌株在菌群分类检测中均为F. graninearum。4.RT-PCR检测小麦赤霉病菌DNA含量标准曲线制作试验利用CTAB法提取小麦赤霉病菌菌株DNA作为模板。选取Tri5基因中特异引物:Tri5F5’-AGCGACTACAGGCTTCCCTC-3’Tri5R5’-AAACCATCCAGTTCTCCATCTG-3’首先进行普通PCR获得500bp大小产物,利用天根胶回收试剂盒进行胶回收。采用核酸浓度测定仪(Thermal)测取浓度3.5ng/ul。随后将回收后的DNA作为模板进行梯度稀释,浓度梯度为10,稀释10000倍。之后,按照SYBR Priemix Ex Taq TM II (Tli RNaseH Plus,TaKaRa)建议体系加入染料和荧光定量PCR反应试剂进行荧光定量PCR,获得标准曲线方程:y=-4.6953lg(x)+6.4496R2=0.9982。5.南陵赤霉菌株的鉴定及相关生长特性研究研究过程中发现一株菌落表型特异菌株,于是对该菌株进行了ITS及PCR-RFLP分子鉴定,并同常见菌株进行了相关生物特性的比较。通过分子生物学方法分别鉴定了其种属类别。测定了其菌丝生长速率,产色素量与产色素速度,产孢量与产孢速度及其致病力,同时完成该菌株与其他常见菌株的上述各测定量的对比。真菌ITS鉴定与PCR-RFLP鉴定结果表明该菌株确定为Fusariumasiaticum无疑,各测定指数如菌丝生长速率,产孢量,致病力等均低于常见赤霉病菌株。