笃斯越桔(Vaccinium uliginosum L.)为杜鹃花科(Ericaceae)越桔属(Vaccinium)植物,与常见的水果蔬菜相比其果实内花青苷和黄酮醇苷等成分含量更高,具有极高的营养价值和经济价值。我国其野生资源主要分布在大兴安岭、吉林长白山等地区,其遗传多样性及遗传结构尚未见报道。本研究以12个不同居群的378个野生笃斯越桔样本为实验材料,应用叶绿体matK和rbcL 2个DNA条形码和EST-SSR分子标记进行了遗传多样性及遗传结构的研究,主要结果如下:1.基于叶绿体matK和rbcL序列及单倍型分析结果显示中国笃斯越桔天然居群遗传多样性水平较低(matK:Hd=0.523,π=0.00337;rbcL:Hd=0.277,π=0.00055)。基于叶绿体的matK基因共划分出25种单倍型,单倍型多样性(Hd)范围在0-0.593之间,核苷酸多样性(π)范围在0-0.00423之间。基于rbcL基因共划分出10种单倍型,单倍型多样性(Hd)范围在0-0.579之间,核苷酸多样性(π)范围在0-0.00212之间。各单倍型均呈现明显的地理分布特征。2.分子变异分析(AMOVA)结果表明基于matK基因的12个笃斯越桔群体中的总遗传变异有21.89%发生在群体内部,有78.01%发生在群体间;基于rbcL基因的12个笃斯越桔群体中的总遗传变异有90.42%发生在群体内部,有9.57%发生在群体间。Mantel检测结果表明:基于matK基因(r=0.94478,p<0.001)与rbcL基因(r=0.58636,p<0.002)的笃斯越桔群体间的遗传距离和地理距离均呈显著正相关。3.44对SSR引物呈现较高的多态性水平,平均等位基因数(Na)范围在3-19之间,平均值为8.52,有效等位基因数(Ne)范围在1.05-14.02之间,平均值为3.42,期望杂合度(He)范围在0.0502-0.9287之间,平均值为0.573。4.基于SSR分析结果表明中国笃斯越桔天然群体遗传多样性同样较低(He=0.5730)。各居群期望杂合度(He)范围在0.5128-0.5787之间,平均值为0.5530,差异较小。群体XL遗传变异程度最高,而且群体群体规模较大,应该优先保护。SSR分析结果表明群体间遗传分化不明显(Fst=0.0349),仅有部分群体间出现了一定程度的遗传分化。5.STRUCTURE分析结果表明12个笃斯越桔群体可以分为大兴安岭亚群和长白山亚群,在378个笃斯越桔样本中非混合基因型有239个,其余139个混合基因型样本,占总样本的36.77%。大兴安岭亚群中的XL群体内非混合基因型所占比例最低为24.24%,长白山亚群中MJZ与DFH群体非混合基因型所占比例分别为 27.27%、29.72%。