本文通过对我院2009-2011年治疗乙型肝炎核苷酸类似物应用分析，结合临床药师在其使用中的监护实践，对我院核苷酸类似物的使用作出疗效评价，为推荐最佳的乙肝抗病毒治疗方案及药学监护方式提供科学依据。对2009-2011治疗乙型肝炎核苷酸类似物使用频度进行归纳分析，得出用药频度在持续升高，说明人们越来越重视抗病毒的治疗，认识到抗病毒是对抗慢性乙肝较有效的方法，可以有效地避免一些并发症的发生。回顾了我院近三年符合核苷酸类似物治疗要求的病历105例，对治疗前后ALT、AST水平、HBV DNA水平、Child-Pugh评分结果进行比较，结果说明核苷酸类似物在短期可以有效地抑制HBV的复制，改善肝功能状况。通过临床药师对乙型肝炎患者开展核苷酸类似物治疗的患者开展药学监护服务，并在服务后开展问卷调查，对临床药师宣教指导前后数据进行比较，结果充分说明在保证患者合理用药，提高药物疗效和避免医疗纠纷方面，临床药师起到了举足轻重的作用。通过综合数据分析建立保证治疗乙肝病毒效果兼顾经济性的科学方案，并证明了在临床药师的干预和指导下，抗病毒治疗能够得到更有效充分的贯彻和实施。