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古茶树(Camellia sinensis)是指生长在天然林中且树龄超过百年的野生茶树,还包括半驯化的人工栽培型野生茶树以及人工栽培超过百年的古茶园中的茶树。贵州是茶树的起源地之一,三都水族自治县拥有丰富的古茶树资源。古茶树经过长时间的不断进化,保留了丰富的遗传多样性,为古茶树优良品种的选育、种质资源的有效利用和保护提供宝贵资源。本研究以三都水族自治县5个古茶树群体的145份供试材料为样本,利用ISSR分子标记技术结合形态特征探索古茶树的遗传多样性,以此探讨贵州三都水族自治县古茶树的遗传特点,为古茶树资源的保护和进一步研究提供理论基础。本研究获得的主要结果如下:1.贵州三都县古茶树表型特征多样性为研究古茶树资源遗传多样性,分析了供试古茶树材料表型性状的多样性指数和变异系数。质量性状中叶质的变异系数最低为18.58%,叶齿深度的变异系数最高为50.64%;多样性指数除了叶质为0.55之外,其他均达到0.75以上。数量性状中叶脉对数的变异系数最低为17.76%,树高的变异系数最大为60.37%;多样性指数均达到了1.5以上,说明供试古茶树样品具有较高的多样性。同时分析了5个分布区古茶树表型特征多样性,各个分布区古茶树表型平均变异系数介于23.92~27.39之间,平均多样性指数介于1.37~1.87之间,说明各个分布区内古茶树的表型特征差异不大。为进一步了解古茶树的遗传多样性,构建聚类图,可以清晰的将供试材料分为4类。2.三都县古茶树种质资源ISSR分子标记筛选从100条ISSR引物中筛选出15条多态性好,可重复的ISSR引物。15条引物对145份供试古茶树材料共扩增出116条带,其中多态性条带有110条,平均多态性条带比率为94.37%,多态性信息指数(PIC)在0.68~0.86之间。用软件POPGENEN计算145份古茶树材料两两间遗传一致度为0.4483~0.9655。乔木间的遗传一致度在0.5431~0.9655之间,灌木之间的遗传一致度在0.7069~0.9569之间,乔木与灌木古茶树的遗传一致度在0.4483~0.7845之间。平均观察等位基因数(Na)为1.9457,平均有效等位基因数(Ne)为1.5293,平均Nei’s遗传多样性指数(H)为0.3126,平均Shannon信息多样性指数(I)为0.4712。145份供试古茶树材料来自5个群体,5个古茶树群体的遗传一致度介于0.7498-0.9334,遗传距离介于0.0689-0.2880。平均等位基因(Na)为1.5453,平均有效等位基因数(Ne)为1.2418,平均Nei基因多样性(H)为0.1501,平均香农信息指数(I)为0.2342,平均多态性位点数为64,平均多态性位点百分率为54.53%。3.三都县古茶树种质资源聚类分析用软件NTSYS-pc 2.1构建UPGMA树状图,在遗传相似性系数为0.72时,将145份供试古茶树材料分为4大类,其中两个灌木分布区的古茶树被聚为一大类,其他乔木古茶树分布区单独聚为一类。综上所述:贵州省三都水族自治县的古茶树群体间有一定的遗传稳定性和聚集性,个体间具有丰富的遗传多样性。