【摘 要】
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本文利用RNA-seq技术对环捕德氏霉Drechslerella brochopaga受线虫提取物诱导三个关键时间点的RNA序列进行测序分析并计算差异基因,对差异基因进行聚类分析。D.brochopaga差异基因得到显著性上调表达功能模块。该模块包含了细胞分裂,细胞伸长、细胞壁合成、转录因子相关基因、枯草杆菌蛋白酶基因,这些基因共同上调表达,可能在捕食器官生成中发挥重要作用。通过对差异基因进行GO
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本文利用RNA-seq技术对环捕德氏霉Drechslerella brochopaga受线虫提取物诱导三个关键时间点的RNA序列进行测序分析并计算差异基因,对差异基因进行聚类分析。D.brochopaga差异基因得到显著性上调表达功能模块。该模块包含了细胞分裂,细胞伸长、细胞壁合成、转录因子相关基因、枯草杆菌蛋白酶基因,这些基因共同上调表达,可能在捕食器官生成中发挥重要作用。通过对差异基因进行GO注释、KEGG注释、富集分析以及比对各大功能数据库(KOG、COG、PHI、CaZyme、Merops)推测,捕食器官形成过程与细胞过程、遗传信息过程、氧化还原过程、催化活性有关。受到线虫提取物诱导后,转录因子调控细胞分裂、细胞伸长、细胞壁合成相关基因例如含WSC结构域基因及含SUR7结构域基因、MAPK部分通路基因例如ste20、转运子MFS、ABC相关基因差异表达,控制收缩环形成过程,同时几丁质酶(db0206152)、丝氨酸蛋白酶(db0207758,db02002051,b0201690,db0207140,db0202319)、机械敏感性离子通道相关基因(MscS-likeprotein,db0203931)等基因上调表达。我们猜测,菌丝受到诱导刺激形成收缩环后,一旦受到来自线虫的机械刺激,机械敏感性离子通道做出响应,G-蛋白相关基因开启包括MAPK在内的多个下游级联反应,收缩环膨胀,内环关闭,几丁质酶和丝氨酸蛋白酶等发挥作用,线虫被牢牢捕捉。本文推测收缩环不仅仅单一地依赖收缩环的机械力发挥其捕食线虫的本领,还能够结合几丁质酶、丝氨酸蛋白酶等对线虫的防御机制进行同步瓦解。本文通过对Drechslerella brochopaga收缩环产生过程中差异基因的研究,推测了收缩环形成以及三细胞膨胀过程中可能发挥重要功能的基因,为研究收缩环形成机理奠定了基础,为生物防治线虫提供了一定的理论依据。
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