大岩桐花萼幼叶差异表达基因的研究

来源 :杭州师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xueyueer001
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基因在不同细胞、不同时期的选择性表达,控制着生长与发育、衰老与死亡、细胞周期调控等重要的生命现象。为了找出大岩桐花萼、幼叶的差异表达基因,我们对大岩桐花萼、幼叶进行了转录组测序,并通过Real-Time荧光定量PCR技术对萜类生物合成通路中的五个基因进行了定量分析,同时应用抑制消减杂交技术构建了差异基因文库。主要研究结果如下:  1、对大岩桐花萼和幼叶的转录组进行了高通量测序,得到如下结果  (1)通过差异表达分析,两样本共获得了30,026个基因,仅在花萼中表达的有1357个基因,在叶片中表达的有1514个基因,共同表达的有27155个基因,其中在花萼中上调的基因有4186个,下调的有3569个基因;  (2)通过基因功能注释,7340条转录物注释到GO,占总转录物的24.45%,涉及到的pathway有265个,包括细胞、细胞部分、蛋白结合、催化活性、细胞过程、代谢过程;通过代谢通路富集,萜类生物合成通路在花萼中显著上调,定位到萜类生物合成通路有15个基因;  (3)通过荧光定量PCR对萜类生物合成中的5个基因的相对表达量进行检测,与测序结果一致。  2、构建了大岩桐花萼、幼叶的抑制消减杂交文库,经过初步筛选,得到了160个阳性克隆,通过PCR检测表明所得阳性克隆的片段大小为500bp-3kb之间。对其进行分析得到了花萼中8个具有较高同源性的差异EST序列。
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