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百合(Lilium)，百合科多年生球根草本植物，是我国传统名花，适于做切花、盆花和园林布景。全世界有90多种，中国有46种18变种，其中原产36种15变种。中国野生百合存在大量变异、遗传多样性丰富，但目前很多资源没有得到利用，且破坏流失严重、多样性逐渐降低，亟待保护。针对这一问题，作者对东北长白山、云南以及陕西部分地区的百合资源进行调查和收集，采用组织培养方法对采集的全部种球进行保存并采用AFLP和cpSSR两种分子标记方法研究采集的50份样品的遗传多样性。主要结论如下。 1．二年来收集到东北长白山、云南大理、丽江、中甸以及陕西太白山的野生百合36种。采自三地百合数量分别为：8种、16种、7种，其余的5种来自北京、福建等地。调查中观察到由于人为挖取百合作食用、药用、观赏以及生境的进一步恶劣等原因，使得野外百合资源存在情况非常严峻。以东北情况最为严重，其次是云南，目前亟需对野生百合尤其是一些特有种进行保护。 2．为更好的利用百合资源，尤其是为百合育种提供理论依据，本研究采用AFLP以及cpSSR标记方法研究百合遗传多样性。针对AFLP反应体系对DNA及模板的质量的严格要求，作者对传统的CTAB法进行了改进，以降低DNA中蛋白质及多糖的含量；同时对酶切时间设置处理，建立并优化百合AFLP反应体系。本研究以麝香百合、窄叶百合两种百合为材料从60对EcoRI／MseI AFLP引物对组合中筛选11对扩增效果较佳的引物用于百合的遗传多样性分析，并最终选择5对多态率高可用于全部材料的引物，产生条带189条，多态性条带123条，多态率为65.07％。各种的多态率集中在28.04％-42.32％之间。根据所得数据，采用相应指标分析中国野生百合遗传多样性，为进一步的研究野生百合提供分子水平上的依据。 3．从12对其他种已经合成的cpSSR特异引物对中筛选4对引物用于百合叶绿体SSR分析，共产生条带数12条，多态率为100％。对所得数据进行聚类，分析起遗传多样性。采用cpSSR方法是对AFLP标记方法的一个补充，同时也验证cpSSR这一分子标记方法在观赏植物中的应用是可行的。 本研究首次采用AFLP标记方法分析百合遗传多样性反应体系并首次尝试将cpSSR分子标记方法应用到观赏植物中。对百合野生资源的收集、保存以及遗传多样性作了研究，为建立百合核心种质以及更好的利用资源打下基础。