目的:氟尿嘧啶类药物广泛应用于各种实体瘤的治疗中，氟尿嘧啶类药物的不良反应与DPYD、TYMS、MTHFR酶密切相关，明确DPYD、TYMS、MTHFR基因多态性与消化道肿瘤的患者应用氟尿嘧啶类药物产生的疗效与不良反应间的关系。　　方法:筛选2011年1月至2016年10就诊于中国医科大学及辽宁省肿瘤应用氟尿嘧啶类药物化疗并且接受过基因检测的胃肠肿瘤的患者，同时统计患者DPYD、TYMS、MTHFR基因多态性的突变率，应用氟尿嘧啶类药物后的不良反应，肿瘤进展时间，总生存期，比较不同基因型间的差异。　　结果:入选患者中，74名患者进行了DPYD、MTHFR基因多态性检测　　一、DPYD与不良反应:　　DPYD基因检测结果:包括DPYD*2B、9A、*6、M166V和F707fs移码缺失突变。DPYD*2B发生率最高(40.5％)，其次为DPYD*9A(13.5％)。DPYD*2B多态性位点不同的基因型出现Ⅲ度以上各类不良反应的发生率差异无统计学意义(P＞0.05)，DPYD*9A多态性位点不同的基因型出现Ⅲ度以上各类不良反应的发生率差异无统计学意义(P＞0.05)。入组患者中有4位同时携带DPYD*9A和DPYD*2B多态性，DPYD*9A和DPYD*2B多态性不同携带情况对应的Ⅲ度以上不良反应发生率差异无统计学意义(P＞0.05)。　　二、MTHFR与不良反应:　　入组患者只携带677C＞T(A222V)1个基因位点多态性，共54例(73.0％)，纯合多态性有20个(27.0％);MTHFR677C＞T多态性位点不同的基因型出现Ⅲ度以上不良反应的发生率差异无统计学意义(P＞0.05)　　三、TYMS基因多态性与不良反应:　　3R/3R多态性14例(22.6％)，包括同时携带3R/3R和-6bp/-6bp的4例(6.5％)，-6bp/-6bp纯合缺失多态性11个(17.7％)。TYMS3R/3R多态性位点不同的基因型出现Ⅲ度以上骨髓抑制的发生率差异有统计学意义(P=0.045)，TYMS-6bp/-6bp多态性位点不同的基因型出现Ⅲ度以上不良反应的发生率差异无统计学意义(P＞0.05)。　　四、DPYD和MTHFR基因多态性与不良反应　　有26名患者同时携带DPYD和MTHFR两种基因多态性，DPYD和MTHFR基因多态性不同状态出现Ⅲ度以上腹泻的发生率差异有统计学意义(P=0.035)。　　五、在药物有效率和疾病控制率方面，DPYD、MTHFR基因检测的患者中，63名晚期患者中57名进行了疗效评价;TYMS基因组中，57名晚期患者中有50名进行了疗效评价。在治疗有效率和疾病控制率方面，多态性与野生型患者间差异无统计学意义。生存分析结果显示无论是DPYD、TYMS、MTHFR三个基因多态性，对OS于PFS均无影响，组间差异无统计学意义。　　结论:本研究中DPYD、MTHFR和TYMS基因多态性与应用氟尿嘧啶类药物发生Ⅲ度以上不良反应有相关性。TYMS3R/3R纯合多态性患者出现Ⅲ度以上骨髓抑制的风险增加。