基于环状RNA差异性表达探索退行性主动脉瓣疾病的发病机制

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jianjiaomylove
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[目的]利用高通量测序技术鉴定退行性变主动脉瓣中差异性表达的circRNA,分析circRNA在退行性主动脉瓣瓣膜病发生发展过程可能的分子机制。[方法]获取主动脉瓣置换手术或心脏移植手术患者主动脉瓣组织,留取部分确定病理分型,其余部分液氮冻存以备提取组织RNA。应用高通量测序技术,分别检测正常主动脉瓣组织(正常组)、纤维钙化主动脉瓣组织(纤维钙化组)和粘液样变主动脉瓣组织(粘液样变组)的circRNA表达谱。分析正常组与纤维钙化组、正常组与粘液样变组组间circRNA表达量变化,并对差异性表达的circRNA进行功能富集分析和通路富集分析。此外,应用miRanda软件预测circRNA可能结合的miRNA,通过Targetscan数据库预测miRNA相互作用的mRNA,探索差异表达circRNA可能的作用机制。[结果]病理结果提示,Illumina Hiseq 2500二代测序平台测序样本共15例主动脉瓣,其中正常组6刺、纤维钙化组5例和粘液样变组4例。与正常组相比,纤维钙化组中发现243个差异性表达的circRNA。其中196个表达上调(80.7%),47个表达下调(19.3%)。差异性表达circRNA的功能富集结果中钙激活钾通道活性和心脏节律相关,通路富集结果中胞吞作用和瓣膜开合能力的起源相关。表达量差异前五的circRNA靶miRNA预测中miR-214-3p、miR-150-5p、miR-7-5p、miR-330-5p、miR-506-5p 和 miR-5003-3p 等和内皮间质转化过程密切相关。与正常组相比,粘液样変组中发现272个差异性表达的circRNA,其中229个表达上调(84.2%),43个表达下调(15.8%)。差异性表达circRNA的功能富集和通路富集结果中泛素介导的蛋白水解作用和内皮间质转化密切相关。表达量差异前五的 circRNA 靶 miRNA 预测中 miR-542-3p、miR-150-5p、miR-4458和miR-335-3p等参与内皮间质转化过程。[结论]退行性变主动脉瓣呈circRNA差异性表达。差异性表达的circRNA在退行性主动脉瓣瓣膜病的发生发展过程尤其是其中内皮间质转化过程可能发挥重要作用,差异性表达的circRNA可能通过竞争性抑制作用抑制相关miRNA的功能从而引起退行性主动脉瓣瓣膜病。
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