念珠菌阴道炎致病菌株的基因组分型研究

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念珠菌一般为条件致病菌,随着器官移植的普遍开展,恶性肿瘤、爱滋病和吸毒者的增多,以及人口的老龄化,导致免疫力低下人群不断增加,全身性真菌感染特别是念珠菌感染也日益增多,已成为各种疾病患者死亡增加的重要原因。随着检测水平的不断提高,真菌感染菌谱也在发生变迁。抗真菌药物的不合理应用,使耐药菌株不断增加,耐药机理日趋多样化。 念珠菌耐药的分子机制相当复杂,耐药株的产生,从分子生物学水平看,是耐药基因表达的结果。而以往的研究多以已知遗传位点的实验方法检测耐药基因,得到孤立的耐药基因,无法系统描绘念珠菌致病菌株的基因组图谱。由于念珠菌感染多为散发性,大样本研究相对难得。 念珠菌阴道炎是妇产科的常见病,大约75%的育龄妇女至少有一次发病,自从多种阴道局部用药和口服唑类抗真菌药物的问世以来,治疗念珠菌阴道炎已有较好的药物,但随着抗真菌药物的广泛应用,耐药现象的报道也在增多,部分病例反复发作,成为顽固性病例。虽然不至于象深部真菌感染那样危及生命,但明显影响生活质量,且发病率高,影响范围广。念珠菌阴道炎中,白念珠菌的检出率占80%以上,近年报道耐药菌增多,则以其它念珠菌,如近平滑念珠菌为多见。由于体外培养鉴定菌株与耐药检测的实验周期长,费用高,且现有的敏感菌株的鉴定以真菌的表型为基础,通过肉眼观察菌液的混浊度决定,因此,主观性较大,结果假阳性概率高,对临床用药指导意义有限。 随机扩增多态性DNA(Random Amplificated Polymorph DNA简称为RAPD)是在PCR技术基础上发展起来的一种新兴的基因分析法。PCR是1985年兴起的一项基因体 浙江大学硕土学位论文 外扩槽的分于生物学新技术,多年来在生命科学研究领域发挥了前所未有的作用。 1990年’if!。和’elsh等人建立了一种新的揭示基因组多态性的方法,即随机扩增 多态性 DNA(RAPD),并在徽生物的分型中广泛应用.RAPD的原理与常规 PCR基本相 同,在RAPD扩增法中,基因组DNA是在低严格条件下,用一种任意序列的寡核甘酸 引物使PCR扩增,这种低严谨的条件下允许引物退火达到基因组上的多处位点,产生 一系列的扩增洲A片段,在聚丙烯酞胺准胶电泳或琼脂糖凝胶上做多态性分析。由于 引物是随机合成的,不必预先知道待测基因组的碱基序列,从原理上讲通过增加随机 引物的数量可以对任何复杂的生物变异进行分型。其结果通过电泳条带的比较分析, 可以揭示基因组间的差异。本研究以念珠菌基因组为楔人点,通过RAPD法,探讨表 型耐药诛与敏感株之间的DNA基因组区别。通过RAP-PCR探讨耐药菌株与敏感菌株之 间的RNA基因组分型.研究中选用临床诊断为念珠茵阴道炎的病例,取阴道分泌物做 真菌学培养,按照法国梅里埃ATB F[JNG[J药敏实验板做药敏筛选。选择典型的敏感 菌株和耐药株为研究标本,实验中以近平滑念珠菌质控株ATCC22019为参考标推。 结果 一 菌群表型鉴定结果 共检测300株临床分高菌株,经法国梅里埃真菌鉴定系 统分析,共检测出六种真菌,它们分别是白念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、热 带念珠菌、酿酒酵母和克柔氏念珠菌。ATB F[JNGUS药敏实验共检测 300株分离真菌 对 6种抗真菌药物:5-氟胞啼陡(Flucytosin)、益康哇(Econazole)、酮康哇 (Ketoconazole)、米康哩(Miconazole)、两性霉素B(AmphotericinB)、制霉菌素’m 缸itu)的最低抑菌浓度*IC人在 300株临床分离株中,最终挑选 154例典 型的敏感与耐药念珠菌进人实验。 二RAP卜盯R 引物的选择 在初步实验中,对 4条随机引物进行筛选,发现其中引物 ERIC 和ERIC皿在RAPI:yPCR反应中能清晰地显示念珠菌种同之间的多态性.用ERIC引物 对 154例典型的敏感茵株和耐药茵株进行 RAPInPCR扩增后获得稳定的基因组指纹图 一2 一 浙江大学硕士学位论立 谱。条带数在 4-7条之间。最大的片段>700hP,最小的片段<100hP。 六个菌种在RAPD扩增和电泳条件相同的情况下,出现图谱条带位置和数目不同 的扩增效果.种瞩之间有明显的区别. 耐药株和敏感株比较 对6种抗真菌药均敏感株与对卜氟胞啮陡耐药?
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