【摘 要】
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目的:通过对卫星胶质细胞转分化为神经元过程基因表达谱的研究,对差异表达m RNA进行筛选,寻找可能调控的靶基因,并对靶基因的功能进行初步验证。希望为卫星胶质细胞转分化过程可能的调控机制提供理论支持。方法:用第二代基因测序技术对诱导的卫星胶质细胞进行转录组测序,通过GO、KEGG等富集分析对测序结果进行筛选,并筛选出可能的靶基因。通过qRT-PCR对靶基因的表达进行验证,并对靶基因敲低后进行功能验证
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目的:通过对卫星胶质细胞转分化为神经元过程基因表达谱的研究,对差异表达m RNA进行筛选,寻找可能调控的靶基因,并对靶基因的功能进行初步验证。希望为卫星胶质细胞转分化过程可能的调控机制提供理论支持。方法:用第二代基因测序技术对诱导的卫星胶质细胞进行转录组测序,通过GO、KEGG等富集分析对测序结果进行筛选,并筛选出可能的靶基因。通过qRT-PCR对靶基因的表达进行验证,并对靶基因敲低后进行功能验证。结果:1.样本间相关性检测R~2均在0.8以上,且相关基因qRT-PCR结果与测序果一致。2.GO以及KEGG富集分析结果显示,Wnt signaling pathway、Neurotrophin signaling pathway这2条pathway之间存在着“crosstalk”。3.对Wnt signaling pathway、Neurotrophin signaling pathway进行蛋白-蛋白网络互作分析结果显示Wnt4、FZD6、Ctnnb1、Igf1、Igf1、Ngf以及Ntrk3为可能的靶基因。4.Ctnnb1在体内以及体外实验中差异结果最为显著,p<0.001。5.敲低Ctnnb1后,细胞凋亡程度明显减轻,且相关因子表达变化趋势与卫星胶质细胞转分化过程中一致。结论:1.测序数据各组内生物学重复之间差异性小,实验具有可重复性。2.Wnt signaling pathway、Neurotrophin signaling pathway这两条信号通路之间存在着crosstalk,且它们之间的交互因子Wnt4、FZD6、Ctnnb1、Igf1、Igf1、Ngf以及Ntrk3可能是关键的靶基因。3.Ctnnb1可能是卫星胶质细胞转分化为神经元过程中的关键调控因子。
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