样品制备与数据处理是代谢组学研究中的两个关键的步骤,它将在很大程度上影响分析结果的可靠性和准确性。本文针对基于核磁共振(NMR)的代谢组学研究中,血清和粪便两种常用的生物样品的制备,以及1H NMR波谱数据前处理等方法进行比较研究。主要内容包括:一、血清样品制备方法对后续分析结果的影响。为了减小样品中的蛋白质和脂质等大分子对血清1H NMR代谢轮廓的影响,一些研究者建议在NMR实验之前先过滤掉血清中的大分子物质,并提出了多种样品制备方法。本文分析了甲醇萃取、乙腈萃取和超滤管过滤等三种样品制备方法的血清1HNMR谱,并与常规方法进行对照研究。结果表明:三种样品制备方法均能较好去除血清1H NMR谱中的大分子信号,而甲醇萃取方法在1H NMR谱的信噪比、分辨率和重现性、代谢物损失量、以及样品制备成本等方面均优于其它方法。二、粪便样品储存条件对后续分析结果的影响。研究储存时间和储存温度两个因素对粪便样品1H NMR代谢轮廓谱的影响。存储时间分别取1天、1周和1个月等三个因素水平,而存储温度取-80℃和-20℃两个因素水平。实验结果表明:储存时间对于代谢轮廓的影响大于储存温度。NMR实验中,粪便样品的储存时间不要超过一个月;若在一周内处理,-80℃的储存温度更利于保留代谢轮廓,在-20℃下储存几小时已经开始发生微生物的变化活动。三、1H NMR代谢轮廓预处理对后续分析结果的影响。分段积分和(半)定量分析是1H NMR代谢轮廓的两种主要预处理方法。本文以大鼠艾灸干预实验的NMR数据为分析对象,采用SpectFitting软件对1HNMR谱进行定量分析,并与常规的全谱分段积分进行比较。结果表明,分段积分方法由于利用了全谱信息,其分析结果更全面,但半定量分析方法的结果更具可靠性。