基于microRNA表达的宫颈癌预后分子风险模型的建立

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhaohui1590
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背景:在全球范围内,宫颈癌(CC)的发病率在女性生殖系统肿瘤中居首位。既往研究表明,microRNA(miRNA)在宫颈癌发生发展过程中发挥重要作用。本研究旨在建立基于miRNA的宫颈癌分子预后模型,为宫颈癌患者提供潜在的预后风险预测工具。方法:利用中国医学科学院肿瘤医院收集的8个宫颈肿瘤组织及4个癌旁组织进行miRNA测序。此外,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载宫颈癌miRNA和mRNA表达数据和临床数据。分析宫颈癌miRNA-seq和TCGA数据库中宫颈癌研究队列的差异表达miRNA。基于差异表达miRNA,利用LASSO回归方法建立宫颈癌的miRNA预后风险预测模型。在TCGA数据集(n=255)中使用R语言对模型进行生存分析、受试者工作特征(ROC)曲线分析以及单因素和多因素分析来评估模型性能。开展实时定量聚合酶链式反应(qPCR)实验验证模型中miRNA在宫颈癌组织和细胞系中的表达量。细胞功能实验用于验证模型中miRNA在宫颈癌细胞克隆、迁移和侵袭中的作用。结果:结合TCGA数据集和宫颈癌组织miRNA-seq,得到了 39个差异表达miRNA,对39个miRNA进行LASSO回归分析建立了包含miR-142-3p和miR-100-3p 的风险模型(风险评分=-0.310×hsa-miR-142-3p 的表达+0.439×hsa-miR-100-3p的表达)。生存分析、ROC曲线分析、患者风险评估以及单变量和多变量分析表明,风险评分模型在评估患者生存(P<0.01)、死亡风险和独立预后(P<0.01)方面具有良好的预测能力。宫颈癌组织样本和细胞系的qPCR检测显示在宫颈癌组织及细胞系中hsa-miR-142-3p低表达,hsa-miR-100-3p高表达,补充了数据库分析结果。在宫颈癌细胞系进行克隆形成实验、迁移侵袭实验,结果表明miR-142-3p可抑制宫颈癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而miR-100-3p可促进宫颈癌细胞增殖、迁移和侵袭能力。结论:基于miR-142-3p和miR-100-3p的预后风险模型可预测宫颈癌患者预后。miR-142-3p在宫颈癌发生发展中可能起抑癌作用,miR-100-3p在宫颈癌发生发展中可能起促癌作用。模型中的miR-142-3p和miR-100-3p在宫颈癌中是潜在的生物标志物和候选药物治疗靶点。
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