经济社会正常运行的必要条件是金融对资源的合理配置,金融在社会经济体系中充分发挥着“催化剂”的作用。金融通过优化资源配置促进国民经济发展,提高系统稳健性,同时为全社会提供金融服务,极大促进我国经济协调发展。在经济发展区域化背景下,金融发展呈现出区域非均衡运行。我国各地区资源分配差异导致区域金融发展不均衡,引发地区资本配置效率不等,影响到各地区的经济发展。基于此,本文根据中国区域金融发展的非均衡性展开分析,在结构和空间维度定性分析三大区域金融发展现状,再从外部环境因素,金融总量因素,金融结构因素和金融效率因素四个维度出发利用因子分析法构建中国区域金融行业发展综合评价模型,利用泰尔指数测度区域金融非均衡性,调整Jefrey-Wurgler模型用以度量东中西区域的资本配置效率,探究内在影响机制。基于研究结论,发现我国各区域金融发展程度差异较大,存在明显非均衡性。进一步发现区域金融发展非均衡性与区域资本配置效率呈现显著负相关。实证结果显示:金融发展程度和资本配置效率存在显著正相关,金融发展与经济发展不协调时会降低资本配置效率;区域金融发展非均衡性对资本配置效率具有负面影响,其中金融发展程度低的地区更易受金融发展非均衡性抑制,如中西部地区的非均衡发展抑制其资本配置效率的提高,而东部地区的金融发展非均衡对其资本配置效率影响较小。因此,当前区域金融发展政策应注重非均衡改善,进而提升资本配置效率,促进金融和经济协调统一发展。