SLC26A4基因的突变检测与一个新的耳聋基因克隆的研究

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听力丧失是最常见的感觉障碍。遗传性耳聋中,约70%为非综合征型耳聋(nonsyndromic hearing loss,NSHL)。学语前NSHL中,以常染色体隐性遗传方式遗传者占80%(其相关位点命名为DFNB),常染色体显性遗传方式遗传者占15%(命名为DFNA),x连锁遗传的占2~3%(命名为DFN)。NSHL具有高度的遗传异质性,到目前为止,已定位了100多个NSHL相关基因位点,其中DFNA52是中国医学遗传学国家重点实验室于2002年定位的一个NSHL的基因位点,最大IrOD值为6.89。其中39个耳聋疾病相关基因已被克隆。其中,GJB2的突变与50%左右的先天性耳聋相关,为最常见的耳聋相关基因;其次即为SLC26A4,占5%~10%。SLC26A4基因突变所导致的耳聋,可以表现为综合征型,也可以表现为非综合征型,且耳聋一般均为学语前性,70%~80%伴有前庭导水管扩张(EVA)。本研究包括两个部分:1.SLC26A4基因的突变检测2.一个新的耳聋基因克聋的研究目的:1.通过对伴前庭导水管扩大的先天性耳聋患者行SLC26A4基因的21个外显子进行突变检测,以明确耳聋患者的基因诊断并对人工耳蜗手术提供参考。 2.通过对一个新的耳聋基因位点的候选基因进行研究,期望克隆该耳聋致病基因。 方法:1.在湘雅医院耳聋专科门诊收集5个拟行人工耳蜗植入呈常染色体隐性遗传且伴有EVA表现的语前性耳聋家系,应用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)结合DNA直接测序方法检测其SLC26A4基因的21个外显子突变情况,并在人工耳蜗植入术中观察耳蜗外淋巴渗漏情况,必要时采用软组织和耳脑胶封堵耳蜗造孔。2.采用候选基因克隆法对一个常染色体显性遗传性耳聋DFNA52位点内的基因进行分析后,通过查找UniGene、GeneCard等基因表达相关数据库,从人或老鼠的耳蜗中分离到的特异表达的基因作为耳聋的候选基因,一共16个(包括HDAC3、FGFBI、SPOCK、KLHL3、HNRPA0、CDC23、GFRA3、EGRl、HSPA9B、CTNNAl、MATR3、PAIP2、PCDHB5、NR3C1、TCERGl、PPP2R2B、),应用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)结合DNA直接测序方法对其进行突变检测。 结果:1.在突变检测研究中,所有患者中共发现4个不同类型的SLC26A4基因突变(包括IVS7-2A>G、IVSlO-12T>A、754T>C、1229C>T),其中在家系A中发现的IVSl0-12T>A为新的突变类型,在有突变3例中术中出现“镫井喷”现象,2例无突变则无此现象。 2.在克隆研究中,在16个候选基因中发现3个碱基改变,这些碱基改变与家系患者、疾病并没有实现共分离,所以这些碱基改变是3个多态,其中HSPA9B基因IVS2+79 81 del tct为新的多态。本研究尚未找到疾病的致病基因,有待进一步扩大检测范围。 结论:1.伴前庭导水管扩大的先天性耳聋约60[%](3/5)可检测到SLC26A4基因突变,而SLC26A4基因突变者可能更常在人工耳蜗植入术中出现“镫井喷”现象,术前良好的影像学评估和遗传学检查将为我们的手术提供重要的参考依据。2.我们检测的16个基因均不是DFNA52的致病基因。
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