【摘 要】
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白斑狗鱼（Esox lucius）是新疆重要的特色鱼类之一,由于白斑狗鱼有着独特的食用和养殖价值,近年来国内外学者在基因组学和性别方面对其展开了大量研究,为了进一步探讨白斑狗鱼的性腺分化的分子机制及基因调控网络。本研究以白斑狗鱼为研究对象,收集了白斑狗鱼五个不同生长发育阶段的雌雄性腺组织,对其进行转录组测序,并对获得的数据进行了初步分析,分析筛选了白斑狗鱼精巢时序性差异表达基因、卵巢时序性差异表达
【基金项目】
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国家自然科学基金项目“白斑狗鱼性别特异标记筛选与性别发育机制的转录组学分析”（项目编号:31660739）课题主持人:张俊杰 副教授（新疆农业大学生命科学学院）；
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白斑狗鱼（Esox lucius）是新疆重要的特色鱼类之一,由于白斑狗鱼有着独特的食用和养殖价值,近年来国内外学者在基因组学和性别方面对其展开了大量研究,为了进一步探讨白斑狗鱼的性腺分化的分子机制及基因调控网络。本研究以白斑狗鱼为研究对象,收集了白斑狗鱼五个不同生长发育阶段的雌雄性腺组织,对其进行转录组测序,并对获得的数据进行了初步分析,分析筛选了白斑狗鱼精巢时序性差异表达基因、卵巢时序性差异表达基因以及雌雄性腺发育差异表达基因,并对上述差异表达基因进行了GO功能富集和KEGG分析注释,实验结果表明:（1）白斑狗鱼雌雄性腺转录组共测得688960135条原始数据,经过质控,将测序原始数据去除接头以及低质量数据后得到672621722条有效数据,总碱基数目是100.9Gb,平均每个样本获得3.36Gb以上的碱基,样品的平均GC含量是48.12%,Q20均在96.12%以上,Q30均在90.26%以上。（2）通过差异表达分析,白斑狗鱼精巢时序性差异表达上调基因有15168个,下调基因有15141个;白斑狗鱼卵巢时序性差异表达上调基因有9405个,下调基因有8379个;白斑狗鱼雌雄性腺差异表达上调基因有26858个,下调基因有24263个。通过各时期差异表达基因比较分析推断白斑狗鱼精巢分化,卵巢发育集中在其孵化后58天左右。（3）通过GO和KEGG数据库的注释,最丰富的生物过程GO terms为:有机氮化合物代谢过程,细胞蛋白质代谢过程等;最丰富的细胞组成GO terms是:乙酰胆碱-门控通道复合体;最丰富的分子功能GO terms是:阴离子结合、嘌呤核苷酸结合、核糖核苷酸结合等。在KEGG数据库中MAPK信号通路、内吞作用、内质网中的蛋白质加工等通路的相关基因表达更为显著。（4）将测序的非重复序列基因与已有的基因组注释信息比对,获得5240份新的转录本。在NR、GO和COG/KOG等7个数据库中分别成功注释了3179、4426、27、1412、2822、996和634个新基因。本实验结果提供了白斑狗鱼不同生长发育阶段的雌雄性腺转录组信息,为白斑狗鱼的性腺发育规律和繁殖调控奠定理论基础,为白斑狗鱼性别分化机制研究提供一定的基础资料,具有一定的科学价值和理论意义。
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