论文部分内容阅读
目的：肝细胞癌（HCC）是我国最常见的恶性肿瘤，最新数据显示每年新发病例有一半以上在中国。其特点是早期发现率低，临床治疗效果差。随着医学技术的发展，出现全基因组外显子测序技术，对疾病在基因层面的研究提供更深入了解的机会。本次实验采取全基因组外显子测序技术（Whole exome sequence）对不同转移潜能的肝癌组织及其癌旁组织、转移潜能表现不一样的6种肝癌细胞株进行测序分析，探讨与肝细胞癌转移有关的基因改变。 方法：将12例 HCC病人根据相应的检查结果分为高转移潜能组及低转移潜能组，每组各6例，提取肿瘤组织及其癌旁组织DNA，进行全基因组外显子测序，另将6种不同转移潜能的肝癌细胞株细胞培养后进行外显子测序。将所得结果进行生物信息学分析对比筛选出与肝癌转移及发生发展的有关基因及其位点。 结果：1.在高低转移潜能组对比中，我们发现40个考虑有致病性突变基因出现在3例或3例以上的高潜能转移性的肝癌组织中，其中UIMC1（rs3733876C/T）、SEMA3C（rs1527482G/A）、SAMD9（rs10279499G/T）、RECK（rs16932912G/A）、PDLIM4（rs4877G/T）、LIMK2（rs3747154A/G）、CRIM1（rs3821169G/T）的突变与肝细胞癌的转移有密切关系。2.大于或等于2例样本并只在肿瘤组织（癌旁中未检测到）中出现的突变的基因有13个，其中ADGB、CTNNB1（rs12191341A/G，rs121913228T/G）、PTPN11（rs121918457C/T，rs397507546 G/T）、TP53、TRPS1考虑与肝癌的形成有关。3.仅存在于HCC-LM3、MHCC-97L、MHCC-97H中SNP位点改变并考虑有致病性的突变基因有9个，仅在表现为低转移潜能性的肝癌细胞株中的突变基因有2个。其中被报道与肿瘤转移相关的为CAPZB（ rs79308175C/T）、 CSF1R（ rs10079250A/G）、 HSPA5（rs143920039A/T）、SORBS3（rs2449331T/C，rs3758036C/T）、RASAL3（rs146624357G/A，rs142945276 C/T）。4.在3种高潜能转移性肝癌细胞株中对比分析后，有69个考虑有影响的SNP改变的突变基因仅出在HCC-LM3中，有30个 SNP发生改变的基因仅出现在 MHCC-97L、MHCC-97H。其中 EHBP1（rs77403174T/C）、FAM189B（rs150296362C/T）、SERPINB13（rs144903442G/A）、ARHGEF1（rs2303797C/T）的突变被报道与肿瘤的复发转移有关。 结论：1.UIMC1、SEMA3C、SAMD9、RECK、PDLIM4、LIMK2、CRIM1、CAPZB、CSF1R、HSPA5、SORBS3、RASAL3、EHBP1、FAM189B、SERPINB13、ARHGEF1等基因的突变与肝细胞癌的转移有关。2. CAPS2、CENPJ、EDAR、PCDHB10等基因突变与肝细胞癌的转移潜能值得关注。3.ADGB、CTNNB1、PTPN11、TP53、TRPS15的突变与肝细胞癌的生成有关。