文冠果WRKY转录因子家族的鉴定及非生物胁迫响应模式分析

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:duyalengp
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文冠果是中国特有的一种优良的木本粮油植物,虽然文冠果作为一种比较重要的经济林木,但以往对文冠果的研究较少,而且主要集中在植物育种研究方面。WRKY转录因子家族在植物生长发育、环境适应等生物学方面发挥着重要作用。最近公布的文冠果基因组序列为鉴定和描述整个文冠果WRKY转录因子家族提供了机会。鉴定成员,探索文冠果WRKY转录因子家族的组成和进化,研究XsWRKY在盐胁迫、ABA、寒冷胁迫下的表达模式,分析差异表达的基因的功能,有利于进一步了解木本植物中XsWRKY转录因子家族的演化以及文冠果抗逆及其调控机制,为文冠果的抗逆品种改良方面提供基因资源和理论基础。本研究得出以下结论:(1)在文冠果中鉴定了 65个XsWRKY转录因子家族成员。(2)文冠果XsWRKY转录因子家族主要分成7个亚家族,其中Ⅱa亚家族成员数量最少,Ⅲ亚家族成员WRKY结构域保守性最弱,Ⅱ亚家族成员最为广泛。(3)各亚家族XsWRKY转录因子家族成员的保守基序和基因结构组成与家族分类具有较高一致性,但不同亚家族间也存在各自特异性的保守基序和基因结构。(4)XsWRKY基因家族可能对ABA、IAA、GA、MeJA、SA激素都有响应,其中以ABA和MeJA激素相关的顺式作用元件数量最多。(5)XsWRKY基因家族中片段重复的占比远高于串联重复,因此片段重复事件可能是文冠果基因组中WRKY基因家族扩增的主要原因。(6)文冠果与大豆、毛果杨、苹果具有较多的共线XsWRKY基因,大豆与文冠果间具有较多WRKY共线基因的原因可能与大豆的古四倍体事件有关。(7)大多数XsWRKY基因在胁迫条件下发生上调表达,预测发现XsWRKY6,XsWRKY22,XsWRKY24,XsWRKY33,XsWRKY34,XsWRKY54等基因在文冠果抗逆中可能发挥重要作用。
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