死亡结构域蛋白超家族进化的生物信息学研究

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本文对于死亡结构域蛋白超家族从分子进化角度,利用生物信息学的理论和方法进行研究。所有的数据来源均基于公共数据库,利用生物信息学方法对现有的数据进行了整理和发掘,试图对超家族的起源、发展及规模形成等厘清进化顺序并总结规律。  本文基于公共数据库利用blast搜索确认了超家族成员在物种间的分布,并通过蛋白质一级序列比对、基因组比较确认了文中所选的超家族成员在自鱼类至哺乳动物进化阶段均为直系同源。  在此基础上,运用ML法和NJ法分别选取对超家族中三类子家族成员9种蛋白从6个物种中共计55条死亡结构域蛋白超家族蛋白的氨基酸序列进行了系统发生分析并构建系统发生树,描述了超家族成员在进化历史中出现的先后顺序。  通过以上的研究结果,初步描绘了死亡结构域蛋白超家族的进化模式,也为分析此类基因同源性较低的超家族提供了新的思路。
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