全文共分六个部分。在前两章中主要综述了化学计量学在过程分析中的应用和化学计量学在中药指纹图谱中的应用。第一章介绍了EFA-MCR方法的研究和发展情况以及化学计量学用于毛细管电泳标准化的研究。第二章介绍了中药指纹图谱的分析方法和化学计量学在中药指纹图谱中的应用。 在第三章中，论述了渐进因子分析(EFA)和多元曲线分辨(MCR)用于酶催化反应机理的研究。使用与木质素结构单元相似的丁香酸(Syringic acid)作为木质素模型化合物，研究漆酶催化丁香酸降解的过程及机理，进而来推断漆酶催化降解木质素的复杂生化反应过程。所得数据用EFA-MCR方法进行分析，用来确定化学反应过程中反应物及中间体的数目及浓度随时间的变化，而且可通过MCR方法得到反应物及中间体的光谱图，为反应中间体及机理推断提供了十分重要的信息。并以此为基础，对该酶催化过程的反应机理进行了合理的解释。 在第四章中，论述了毛细管电泳谱图的标准化研究。提出了新的方法用于提高毛细管电泳重现性。首先，确定标记毛细管电泳峰的数目N。根据图谱中峰的多少和迁移时间来选择合适的标记峰作为标准化的标尺。然后按照标记峰将每个图谱分为N+1部分，使用插值法将所有图谱中位置相同的每一部分做等长处理，根据样品处理的需要，可以考虑根据标记峰吸收值对其他数据进行吸收值的标准化处理。最后，再将每个图谱中所有的由标记峰分割的部分重新组合起来形成新的图谱。这样就完成了对若干组图谱的标准化处理。 第五章论述了中草药指纹图谱相似度计算方法。通过数据标准化、复杂体系相似度比对等一系列方法来进行中药指纹图谱的研究，从而提出和设计中药质量控制系统。并根据中药体系的复杂性、整体性、模糊性特征，结合模糊数学概念，提出了模糊相似度的计算方法。 第六章的简单介绍了我们研制的《中药指纹谱图相似度的计算及评价系统》。