金融创新是商业银行在激烈的市场竞争和波动的经济环境中生存和发展的动力源泉，但关于商业银行金融创新的研究相对技术创新还较为落后，实践中我国商业银行对金融创新的管理也较为模糊和混乱，因此有必要从系统观构建商业银行金融创新系统并对其运作、发展和演化做出分析。本文的主要研究内容分为六个部分。通过分析商业银行金融创新的宏观环境，文章首先从系统观简要阐述了商业银行金融创新的外部影响力；进而以银行内部金融创新的运作过程为线索构建了商业银行金融创新系统，对其内涵、特征、内部构成要素、结构、边界和功能做了深入地分析，并从比较研究的角度阐述了国内外商业银行金融创新系统的共性和差别。在第三部分中，本文研究了商业银行金融创新系统运作的动力机制，主要分析了在专利保护缺失的状态下银行创新的动力。系统随时间推移不断地演化变迁，在第四部分，本文利用自组织理论研究了商业银行金融创新系统的自组织演化过程，对其演化阶段、自组织性、演化机制、动力和过程等做了详尽的分析。在理论研究的基础上，文章进一步对商业银行金融创新系统的运行做了实证分析，最后针对系统高效运作提出了相关的微观策略和宏观保障建议。本文的创新之处主要体现在四个方面。第一，本文构建了商业银行金融创新系统，将其定义为商业银行的创新者借助于科技进步、新的风险分担方式、服务流程上的新需求、制度上的变迁、市场中的机遇等，通过对现有金融合约的拆分组合、服务方式的改变，新的资源配置方式的采用抑或对已有金融产品的吸纳、调整和模仿，使得创新成果取得商业上的成功的一切活动所附带的条件、规则、结构、过程、方法等的总和。并对该系统的内部构成要素、结构等做了详尽的阐述。第二，通过建立经济学模型强调在专利制度保护不健全的情况下，由于客户转换成本的存在和创新银行关于金融创新产品的知识累积而使其具有了创新带来的先动优势，因此得出商业银行客户资源、客户忠诚度、银行内部信息和知识的传播程度影响着银行金融创新的发展。第三，利用自组织演化理论研究了商业银行金融创新系统的发展演化，分析了系统演化的阶段和自组织演化机制，并建立模型分析了系统演化的动力和演化过程。第四，以网上银行这一创新为例，通过建立银行异质性因子和采纳时间的回归模型，认为资产收益率和非利息收入占比对银行采纳决策有重要影响，然后根据各年已采纳网银业务的银行数和潜在采纳的银行数量，分析了网银扩散随时间变化的趋势，在纳入外生因素后，通过回归模型发现其扩散速度与市场集中度、上网计算机数成正比，与居民储蓄余额、管制程度成反比。