理解其他物质与蛋白质相互作用有助于了解蛋白质功能以及调控蛋白质的行为,故其已成为化学、生物与医学领域中的研究热点。原子力显微镜（AFM）是研究生物或非生物样品的一种重要工具,不仅可以在大气或液体环境对生物材料在原子尺度上进行表面测量,还能从单分子水平上对生物分子动态识别过程进行解析,是生物分子相互作用研究的强有力手段之一。因此,本论文以金-二硫化钼复合材料（AuNP-Mo S₂）、金纳米颗粒（AuNPs）和吗啉核酸（MO）为模型物质,利用AFM考察了纳米材料/蛋白质、人工核酸/蛋白质的相互作用。具体内容如下:1.基于AFM探究AuNP-Mo S₂对β淀粉样蛋白1-40(Aβ₄₀)纤维化的双重作用首先将不同浓度的AuNP-Mo S₂与Aβ₄₀共孵育,然后用AFM与Th T荧光光谱分析AuNP-Mo S₂对Aβ₄₀纤维化过程的影响,发现低浓度的AuNP-Mo S₂能够促进Aβ₄₀淀粉样纤维的形成,高浓度的AuNP-Mo S₂反而会抑制Aβ₄₀淀粉样纤维的形成。此外,无论是低浓度还是高浓度的AuNP-Mo S₂,都会减少Aβ₄₀纤维化过程的迟滞期。然后将AuNP-Mo S₂与预先形成的Aβ₄₀纤维共孵育,发现高浓度的AuNP-Mo S₂对Aβ₄₀纤维有一定的解聚效果。最后对实验机理进行分析,产生浓度效应的原因可能是由于AuNP-Mo S₂在Aβ₄₀纤维化过程中起到了“核”的作用,同时吸附在AuNP-Mo S₂上的Aβ₄₀单体与溶液中游离Aβ₄₀单体的比例也是不同浓度AuNP-Mo S₂对Aβ₄₀纤维化过程影响不同的原因。本工作有助于发展一种新型的淀粉样蛋白抑制剂。2.基于AFM探究AuNPs对Aβ₄₀单体/Aβ₄₀单体相互作用的影响首先将AuNPs通过硅烷化试剂修饰到玻片表面,将Aβ₄₀单体分别固定在AFM针尖与基底。然后利用AFM单分子力测定技术考察在铜离子(Cu²⁺)存在下,AuNPs对Aβ₄₀单体/Aβ₄₀单体相互作用的影响。结果发现Cu²⁺能提高Aβ₄₀单体/Aβ₄₀单体相互作用力值。而AuNPs可以抑制Cu²⁺对Aβ₄₀单体/Aβ₄₀单体相互作用的影响。这可能是由于AuNPs起到过氧化氢酶的作用,使得Aβ₄₀还原Cu²⁺产生的过氧化氢浓度降低,从而抑制了Cu²⁺对Aβ₄₀相互作用的促进效果。本工作为酶促反应研究提供一种新的思路。3.基于AFM探究MO探针/血管内皮生长因子（VEGF）和核酸适配体/血管内皮生长因子相互作用相比天然核酸而言,核苷酸类似物MO具有特异性强、抗酶切以及亲和力强等特点,但鲜见MO与蛋白质相互作用的研究。本文以VEGF为模型分子,采用AFM和SPR探究核酸适配体/VEGF的相互作用,并同时探讨同序列的MO探针/VEGF相互作用。结果发现核酸适配体/VEGF有较强的特异性相互作用,而MO探针与VEGF没有发生明显特异性相互作用,这可能是由于MO的刚性主链和电中性所致。本工作为MO与生物分子相互作用提供了新的信息。