鱼类寄生原虫是造成鱼类疾病主要的病原体之一,但由于其个体微小、难以用肉眼观察,常在疾病诊断与防治过程中被忽略。原虫常损伤鱼体后,继发其他病原体感染,从而引起更严重的危害,甚至造成鱼大量死亡,极不利于鱼类养殖产业的可持续发展。为了了解河北省冷水鱼寄生原虫的种类及季节流行情况,本研究按季节采集河北省境内的冷水鱼80尾（共采集组织样本183份）和水环境样本334份。通过形态学方法鉴定出冷水鱼不同组织部位寄生的三种原生动物,分别为:车轮虫、斜管虫、固着类纤毛虫,且均已报道过对冷水鱼的寄生。根据形态学鉴定结果,我们建立了上述三种原虫的分子生物学检测方法,并对其特异性和敏感性进行了确认,以期对形态学结果加以印证。同时,首次建立了鱼类肠道寄生原生动物—芽囊原虫和鳃组织附生原生动物—前口虫的PCR检测方法。对采集的河北省冷水鱼组织样本和水环境样本进行DNA提取后,根据已建立的检测方法,对组织样本和水环境样本进行了车轮虫、斜管虫、固着类纤毛虫、前口虫和肠道芽囊原虫的分布情况进行了调查,结果显示,河北省冷水鱼组织样本中,车轮虫的检出率为92.90%,测序结果显示为高鳞车轮虫Trichodina koloti;斜管虫为91.80%,均为钩刺斜管虫Chilodonella uncinata和Chilodonella piscicola两种;固着类纤毛虫为100%,包括钟虫（Vorticella campanula和Vorticella natans）、累枝虫（Epistylis plicatilis、Epistylis wuhanensis和Epistylis hentscheli）等;前口虫为74.86%,均为Frontoniidae sp.b Omb2;芽囊原虫为1.10%,为ST1亚型;水环境样本中,车轮虫、斜管虫、固着类纤毛虫和前口虫的检出率分别为93.11%、85.93%、94.31%和79.34%,种类与组织样本中检出的物种相同,芽囊原虫检出率为6.29%,与组织样本不同的是,水环境样本中检出的亚型包括ST1、ST2、ST10、ST21和ST24。统计分析组织检出率、水环境检出率及其与季节的关系,结果显示,不同季节中,车轮虫的鱼组织检出率无显著差异,而水环境检出率存在显著差异;斜管虫的鱼组织检出率存在显著差异,水环境检出率无显著差异;固着类纤毛虫、前口虫及芽囊原虫的鱼组织检出率与环境体检出率均无显著差异。冷水鱼养殖作为河北省重要的支柱产业之一,目前已经发展成为我国北方最大的鲟鱼养殖基地,冷水鱼的年产量跻身于全国第五,但各种病原流行规律的不清晰,一直阻碍我省冷水鱼的生态化养殖及高效育种。本研究首次对河北省冷水鱼寄生原虫进行调查,并进行分布规律分析,研究数据不仅对河北省冷水鱼疾病的生态化防治提供了数据支撑,也为水产养殖业可持续发展策略的制定奠定基础。