斑马鱼肿瘤坏死因子样配体1A(TL1A)及其受体DR3基因的鉴定和表达分析

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Tianzh
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肿瘤坏死因子样配体1A(tumor necrosis factor ligand-related molecule-1A,TL1A),属于肿瘤坏死因子超家族成员15(tumor necrosis factor superfamily member15,TNFSF15),它与肿瘤坏死因子受体超家族成员死亡受体3(death receptor3,DR3)结合,通过对T淋巴细胞的作用影响机体的免疫应答,还具有抑制肿瘤生长的作用,同时还能激活NF-kB与胱天蛋白酶(caspase)诱导相关细胞凋亡。在炎症发生发展过程中,炎症细胞的TL1A表达水平显著提高。TL1A可促进炎性细胞因子的合成和分泌,增强宿主对外源移植物的排异反应,在炎性疾病的发生发展中起到重要作用。目前还未见对硬骨鱼类肿瘤坏死因子样配体1A及其受体DR3的克隆鉴定研究,本研究以斑马鱼为研究对象,利用分子生物学、生物信息学等相关手段,从斑马鱼基因组中筛选获得具有TNF结构域的分子TL1A及具有TNFR结构域(TNFR domain)和死亡结构域(death domain)的TL1A的受体DR3,对它们进行克隆鉴定、表达模式分析、病原刺激等研究。  斑马鱼TL1A基因cDNA全长为1709bp,开放阅读框(ORF)长702bp,编码233个氨基酸;预测的蛋白分子量和等电点(PI)分别为27.22kDa和6.32;其氨基端具有一个跨膜结构,羧基端为TNF结构域。系统进化树显示斑马鱼TL1A与硬骨鱼类TNF分子有较高同源性,在进化树中聚类为一支,而与哺乳动物、鸡等的TL1A的同源性低。TL1A mRNA在鳃、头肾、脾脏、皮肤等所有被检测的组织中呈组成型分布,在肌肉、皮肤中表达量较高。斑马鱼脾脏和头肾组织中TL1A mRNA的表达量在嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)刺激后6小时显著增加。  斑马鱼DR3基因cDNA全长为1602bp,开放阅读框(ORF)长1122bp,编码373个氨基酸;预测的蛋白分子量和等电点(PI)分别为42.33kDa和8.18;其氨基端具有TNFR结构域和死亡结构域。DR3mRNA在鳃、头肾、脾脏、皮肤等所有被检测的组织中呈组成型分布,在鳃、小肠、皮肤和头肾中表达量较高。斑马鱼脾脏和头肾组织中DR3mRNA表达量在人工感染嗜水气单胞菌(A.hydrophila)刺激后第6小时呈显著增加。  研究结果表明,斑马鱼的肿瘤坏死因子样配体1A(TL1A)及其受体DR3能响应嗜水气单胞菌处理引起的免疫应答,研究结果为深入研究硬骨鱼类肿瘤坏死因子超家族成员的结构与功能奠定重要基础。  JAK酪氨酸蛋白激酶-信号传导和转录激活因子(Janus kinase-signal transducers and activators of transcription,JAK-STAT)信号通路是动物机体内普遍存在的的重要细胞信号通路之一,在脊椎动物中,其主要参与到调控多种细胞因子的表达和分泌。细胞因子信号转导抑制因子(Suppressor of cytokine siganaling,SOCS)家族是重要的JAK-STAT途径抑制蛋白,细胞因子诱导SH2蛋白(cytokine inducible SH-2containing protein,CISH)是目前已知的8个SOCS的家族成员之一,对包括白细胞介素2(interleukin-2)在内的细胞因子具有调控作用。本研究克隆得到长度为1685bp的鲤(Cyprinus carpio)CISH的cDNA全长,其中开放阅读框(ORF)长666bp,编码221个氨基酸,推导的蛋白质分子量为24.91kDa。CISH具有典型的SOCS家族结构特征,其功能域包括N区、中央SH2结构域和C端SOCS box结构域,它们同样保守地存在于其他硬骨鱼类的CISH蛋白中。系统进化分析表明,鲤鱼CISH与同属鲤科的草鱼和斑马鱼的亲缘关系最近。组织分布结果表明,CISH在鲤鱼血液中的mRNA表达水平最高,在肝脏中的表达量最低。嗜水气单胞菌(A.hydrophila)刺激后,CISH在血液中表达量在24h后出现显著上升,并在48h后恢复正常水平,暗示CISH可能在鲤鱼免疫应答过程中起重要作用。
其他文献
食品灭菌技术一直是各项食品处理技术之中的重点,传统的食品灭菌技术可分为热力灭菌技术与非热力灭菌技术两类,其中热力杀菌技术应用最为广泛。但是热力灭菌技术往往会造成食品
该文应用体外方法对分离的线粒体进行功能检测,探讨caspase,Bid蛋白BH3结构域短肽和重金属离子镉对线粒体及其PTP功能的影响.结果表明重组caspase-3使分离线粒体的态4呼吸速
本文引用连续渗流理论构造了股票市场指数波动模型,得到其特征函数收敛于Levy过程这一结论.并且在模型中也体现出了市场波动的“宽尾”现象. In this paper, the continuous
该论文分为三部分:第一部分为斑头雁脱氧血红蛋白2.8A分辨率晶体结构及其变构机理的研究.研究发现斑头雁deoxyHb的四级结构与人deoxyHb有明显的差异,相对于oxyHb的三级结构变
期刊
期刊
航空电子系统复杂性的增加对航空数据总线的带宽提出了更高的要求,航空电子全双工交换式以太网(AFDX)的成功应用促使航空电子系统进入新的高度综合化的时代。端系统作为AFDX网络
雄激素通过雄激素受体(androgenreceptor,AR)的介导,对胚胎期动物中枢神经系统的性分化起着重要作用.胚胎发育中期促性腺激素分泌活跃,后期降低可能与类固醇激素如雄激素或来
厚朴是中国传统的中药材,为了快速、准确、直观地鉴别厚朴及其伪、混品,该文尝试使用一类基于PCR的原理的DNA分子遗传标记技术——多重任意扩增子图谱(MAAP)技术对中药材厚朴
干式空心电抗器对于改善电能质量、提高电力系统稳定性具有重要的作用,被广泛应用到电网中。电抗器在长期运行中受到热老化、投切电动力、操作过电压和环境条件等因素的影响,匝