水资源保护关乎人民群众切身利益,水污染防治与居民日常生活相关,水污染防治审计工作也势在必行,而水污染防治审计内容涉及面较广,需要结合环境科学、化学、水生物学、统计学等专业知识体系。现阶段,水污染防治审计项目评价指标中没有统一的标准,在具体审计项目中,审计人员更加注重合规性审查,而对实质性审查缺乏必要的评价要素,造成指标选取不全面,进而使得评价结果难以准确评价水污染防治政策落实等情况,直接导致了很多审核人员不能客观地全面剖析环境污染控制审核重点关注的内容,综合数据分析结论存在误差,导致审计整改达不到应有的效果。本文主要针对水污染防治审计,开展水环境治理评价研究。水污染防治审计主要以水污染防治及生态环境保护等作为研究对象,依托水污染防治审计标准,采取有效的审计方法,对审计主体的水污染治理活动做出评价,这是政府部门开展水污染防治的重要手段之一。实施水污染防治审计就必须要一套科学完善的指标评价体系,是能发挥审计作用的基础。因此,本文利用PSR（压力—状态—响应）模型建立起一套框架科学、指标全面、效果明晰的水污染防治审计评价体系。结合沱江流域污染防治专项审计项目案例,运用层次分析法、环境优值模型等方法对水污染防治审计评价指标进行分析,最终提出使用该模型构建的评估系统的运用途径,以推动自然资源的发展、提升水污染防治审计项目的有效性评估、弥补改进现行的评价指标体系内涵,推动建立水污染防治审计的监督机制,为我国水污染防治审计实践提供有益借鉴。