新时代背景下,高质量发展势在必行,但是之前粗放型经济增长方式对水生态环境造成了巨大的损害。水生态环境如何改善成为党和国家面临的重要课题之一。各地进行了积极探索,其中,河长制开创了由各级党政机关主要领导担任“河长”,统筹区域内河湖的管理和保护工作的治理范式,通过发挥党政领导的主体作用,组织政府各部门和社会力量形成治理合力,解决了一大批长期存在的河道整治和保护难题,已经成为解决水生态环境问题的有效制度实践。R市自2017年开始在全市实施河长制,经过几年的时间的努力,为R市百姓的生活、就业以及创业环境带来意想不到的变化。但是肯定成绩的同时,仍然可以发现R市河长制实施中暴露出诸多短板。论文通过对R市的实践研究,发现R市在实施河长制过程中存在涉河违法行为打击力度不够、参与主体单一、政府部门各自为政、基础设施不完善、考核力度不够的问题,这些问题严重的制约着水资源保护工作的开展。根据河长制的特点,本文引入协同治理理论和整体性治理理论分析框架,分析出R市存在这些问题的原因主要是涉河法制体系不完善、多元主体参与制度缺失、政府工作机制有待改进、资金保障和科技投入不到位、缺少适应河长制的考核评价机制。进而从理论结合实践的角度给出五个方面的对策建议:一是加强司法保障体系建设提高违法成本方面,要加强行政执法力度、建立“河长+警长+检察长”联动机制、推动水生态领域公益诉讼工作;二是从多元主体参与方面鼓励企业和社会组织参与、呼吁公众和志愿者参与、主动接受社会监督;三是从改进工作协调机制方面强化河长制办公室职能定位、明确河长及各部门职责分工、强化部门间、区域间协同、加强人才队伍建设;四是从加强资金供给和科技应用助力方面合理运用财政资金、适当引入社会资金、加强河长制管理系统和河流治理新技术的应用;五是从建立科学考核评价机制方面合理制定考核办法、提高考核可信度和公正性、科学应用考核结果。R市的河长制工作实践任重道远,希望理论的探索能够给以启发。