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番茄黄化曲叶病(Tomato yellow leaf curl disease)已经成为世界番茄生产上的主要病害之一,近几年,在我国迅速传播,严重威胁到我国的番茄生产。该病由双生病毒科菜豆金色花叶病毒属番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)引起,主要通过烟粉虱(Bemisia tabaci).培育抗病品种是阻止该病蔓延的最根本有效的途径,据报道,番茄栽培种种质资源中缺乏抗TYLCV的基因,仅有一些表现为耐病的种质。高抗TYLCV的基因都存在于近缘野生种质中,目前已报道的抗番茄黄化曲叶病的近缘野生种主要有醋栗番茄(S.pimpinellifolium)、秘鲁番茄(S.peruvianum)、多毛番茄(S.habrochaites)、智利番茄(S.chilense)和契斯曼尼番茄(S.cheesmanii)。因此,TYLCV的抗性育种很大程度上基于从野生种向栽培种中转入抗性基因。为了应用分子标记辅助选择技术加快抗病品种培育进程,阻止该病蔓延,本试验以抗病亲本CLN2777A和感病亲本TMXA48-4-0及其F2分离群体为材料,应用AFLP和SSR两种标记技术以及BSA法进行与抗TYLCV基因连锁标记的筛选。同时利用国外开发的分别与抗TYLCV基因Ty-1, Ty-2, Ty-3连锁的标记进行分子标记辅助选择聚合研究,研究结果如下：1.通过对亲本及F2分离群体进行TYLCV接种,发现F2代抗感病分离比率接近3：1,表明抗性受单个显性基因控制。用512对Mse I/Pst I引物组合对亲本及F2代抗感基因池进行AFLP分析,最终引物组合P15/M28与P16/M10在亲本及抗感组间表现多态性,,回收并克隆测序,两片段大小分别为106bp,180bp,分别命名为P15M28-106,P16M10-180.重新设计引物,将P15M28-106成功转化为CAPS标记,命名为P15M28.应用一个F2群体对其进行验证,遗传连锁分析结果表明标记P15M28与抗性基因Ty-2之间的遗传距离为8.8cM,可以应用于标记辅助选择育种。除此之外,根据Kenta Shirasawa (2010)构建的番茄遗传图谱,选取11号染色体末端,TG36到TG393区间上的7个SSR标记,应用同样的亲本和F2群体进行筛选,发现一个与抗TYLCV连锁的EST-SSR标记TES0344,与抗性基因遗传距离为7.8 cM。2.应用分别含有Ty-1, Ty-2, Ty-3三个抗TYLCV基因的育种材料TY52,CLN2777A,99S-C-39-20-1-1-24-17-0-0,以及三个园艺性状优良的感病材料Tmm9060-0, TMXA48-4-0, TA1218,按计划配置杂交组合,每一代都应用对应的标记进行分子标记进行筛选,目前已得到Ty-1与Ty-2, Ty-1与Ty-3, Ty-2与Ty-3两两聚合的纯合抗病材料各一株系。