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本研究利用分子生态学方法,应用Illumina Hi Seq 2500高通量测序技术和构建土壤细菌16S r RNA基因克隆文库的方法来分析敦煌地区不同类型盐碱土壤中细菌多样性、群落结构及其与土壤理化性质之间的关系,从而揭示敦煌地区不同类型盐碱土壤中细菌群落组成的多样性。主要研究结果有:(1)高通量测序技术对14个土壤样品优化后的序列进行划分共得到4997个OTUs。主要分归于厚壁菌门(Firmicutes),放线菌门(Actinobacteria),变形菌门(Proteobacteria),Deinococcus-Thermus,拟杆菌门(Bacteroidetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),绿弯菌门(Chloroflexi),酸杆菌门(Acidobacteria),浮霉菌门(Planctomycetes),纤维杆菌门(Fibrobacteres)等17个菌门以及未知类群。克隆文库构建的9个土壤样品中共得到厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)这6个菌门以及未知类群。在所有土壤样品中优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)。(2)高通量测序技术共发现266个属(包括所占比例小的菌属和未知菌属)。三类土壤样品中的优势菌属均为肠球菌属(Enterococcus);通过构建土壤细菌16S r RNA基因克隆文库发现,戈壁土壤和绿洲土壤样品中肠球菌科(Enterococcaceae)为优势类群,过渡带土壤样品中假单胞菌科(Pseudomonadaceae)为优势类群。(3)对三类土壤样品的多样性指数研究表明,绿洲土样的细菌群落多样性和丰富度高,戈壁土样的细菌群落多样性和丰富度低。(4)环境因子中p H值、速效钾、速效氮、有效磷和土壤电导率对细菌群落组成影响大,其中土壤p H值和电导率对细菌群落的影响明显。酸杆菌门、Candidate_division_TM7和绿菌门与土壤p H呈显著负相关。酸杆菌门与土壤电导率成极显著负相关。放线菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、Candidate_division_TM7、绿菌门和蓝藻细菌与土壤电导率呈显著负相关。仅有厚壁菌门与土壤电导率呈显著正相关。(5)厚壁菌门广泛分布在三类土壤样品中,其中存在于戈壁土样中的丰度最高。特别的是随着土壤电导率的增加,厚壁菌门的丰度增加。(6)高通量测序的14个土壤样品的序列分隶属于细菌类群的17个门和未知类群,构建土壤细菌16S r RNA基因克隆文库的9个土壤样品中发现6个细菌门类,这6个门类在高通量测序的结果中都可以得到。通过研究可以发现敦煌地区含有大量的未知细菌类群,细菌资源丰富。