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第一部分湖南汉族经典1型糖尿病HLA-DR-DQ基因多态性分析 目的:系统探讨湖南汉族经典1型糖尿病(T1DM)易感性与保护性HLA-DR-DQ基因型与单体型。 方法:采用聚合酶链反应直接测序法(PCR-SBT)对558例经典T1DM和930例正常对照的HLA-DRB1、DQA1与DQB1位点进行基因分型,通过PHASE软件进行单体型构建。病例组与对照组的基因频率比较采用卡方检验。 结果: ①9种DR与DQ等位基因在T1DM中的频率显著增高,相对风险最高的前3种为:DRB1*0301(21.37% vs.5.78%,OR=4.43,注:患者组vs.对照组,Pc<0.001,以下同)、 DRB1*0401(2.25% vs.0.60%, OR=3.84)、DQB1*0201(23.46% vs.7.4%, OR=3.84);16种等位基因在T1DM中的频率显著减低,保护性最强的前3种分别为:DRB1*1301(0.41% vs.2.45%,OR=0.16)、DRB1*0406(0.51%vs.2.92%, OR=0.17)、DQB1*0602(1.03% vs.4.79%, OR=0.21)。 ②13种DR与DQ基因型在T1DM中的频率显著增加,相对风险最高的前3种基因型为:DQA1*03/03(39.76% vs.1.81%,OR=35.83)、 DQA1*03/05(21.67% vs.1.03%,OR=26.49)、 DRB1*0405/0701(1.84% vs.0.12%, OR=15.71);7种基因型在T1DM中的频率显著减低,保护性最强的前3种为:DRB1*0803/0803(0.61% vs.5.13%, OR=0.11)、DQA1*0102/0102(0.60% vs.3.88%, OR=0.15)与DQA1*010X/0102(010X=0101或0104;0.80% vs.4.91%,OR=0.16)。 ③19种DR-DQ单体型在T1DM中的频率显著增加,相对风险最高的前3种为:DRB1*0901-DQA1*03(30.73% vs.0.22%, OR=203.07)、 DRB1*0301-DQA1*03(6.19% vs.0.07%,OR=90.77)、DQA1*03-DQB1*0201(3.52% vs.0.07%, OR=51.82);22种DR-DQ单体型在T1DM中的频率显著减低,保护性最强的前3种为:DRB1*0803-DQA1*03-DQB1*0601(0.12% vs.3.95%, OR=0.03)、DRB1*0901-DQA1*0102(0.11% vs.1.96%, OR=0.06)、DQA1*03-DQB1*0601(0.325 vs.4.57%, OR=0.07)。 ④本研究人群(中国人)与高加索人、日本人及韩国人比,四个种族共有的等位基因为易感性的DQB1*0303与DRB1*0405,保护性的DQB1*0301, DQB1*0601与DQB1*0602。1种保护性等位基因(DQB1*0502)、4种易感单体型(DRB1*0301-DQB1*0303、DRB1*0301-DQA1*03-DQB1*020、 DRB1*0301-DQA1*03-DQB1*0303与DRB1*0901-DQA1*05-DQB1*0201)与3种保护性单体型(DRB1*0406-DQB1*0302、DRB1*0803-DQA1*03-DQB1*0601、DRB1*1202-DQA1*060Y-DQB1*0301)为中国汉族人群特有性的风险等位基因或单体型。 结论:本研究发现中国汉族8种特有性的DR-DQ风险等位基因与单体型, HLA-DR-DQ易感基因型与单体型对T1DM的遗传效应有显著的异质性。 第二部分锌转运体8自身抗体与HLA-DR-DQ基因多态性关联 目的:探讨锌转运体8自身抗体(ZnT8A)与HLA-DR-DQ基因多态性的关联,以阐明ZnT8A产生的HLA遗传学基础。 方法:选取422例由放射配体法检测的ZnT8A、谷氨酸脱羧酶抗体(GADA)或蛋白酪氨酸磷酸酶抗体(IA-2A)阳性的1型糖尿病(T1DM)患者,同时采用PCR-直接测序法进行患者HLA-DR-DQ基因分型。采用二元关联检验与卡方检验分析ZnT8A与HLA-DR-DQ易感基因型及单体型的关系。 结果: ①湖南汉族经典T1DM患者ZnT8A阳性率为36.3%(153/422),其中单一ZnT8A阳性率为6.8%(28/412),ZnT8A与GADA双阳性率为25.1%(104/415);ZnT8A与IA-2A双阳率者为18.2%(75/412);ZnT8A、GADA与IA-2A三阳性率为15%(62/412)。 ②ZnT8A滴度与易感基因DQA1*05(γ2=0.126,P=0.012)及DQA1*03/05(γ2=0.138,P=0.006)呈正相关,与易感基因型DQB1*0303/0303(γ2=0.142,P=0.006)及DRB1*0901/0901(γ2=-0.114,P=0.029)呈负相关。 ③携带基因型DQA1*03/05(45.8% vs.32.7%)的T1DM患者ZnT8A阳性率分别显著高于非携带者(P<0.05);而携带基因型DQB1*0303/0303(25.0% vs.38.5%)、DRB1*0901/0901(26.6% vs.39.2%)、单体型DQA1*0102-DQB1*0601(12.5% vs.37.2%)与DRB1*0901-DQA1*03(29.6% vs.41.6%) T1DM患者ZnT8A阳性率分别低于这些基因非携带者(P均<0.05)。 ④携带易感基因DQA1*03/060Y(75.00% vs.16.67%)、DQB1*0301/0301(44.44% vs.17.14%), DRB1*1401-DQA1*010X(80.00% vs.17.12%)者单一ZnT8A阳性率显著高于非携带者(P均<0.05);携带易感基因DQA1*03/05(6.98% vs.16.67%)、DRB1*0901-DQA1*03-DQB1*0303(4.88% vs.25.35%)者单一ZnT8A阳性率显著低于非携带者。 结论:ZnT8的自身免疫反应与DRB1*1401-DQA1*010X与DRB1*0901-DQA1*03-DQB1*0303单体型有关,结果也进一步表明特异性胰岛自身抗体的产生与HLA-Ⅱ类基因相关。 第三部分湖南汉族1型糖尿病IFIH1基因rs1990760多态性分析 目的:分析患者IFIH1基因rs1990760多态性与湖南汉族急性起病1型糖尿病(T1DM)及成人隐匿性自身免疫性糖尿病(LADA)的关系。 方法:设计病例对照研究,应用TaqMan探针实时荧光PCR技术对930例湖南汉族T1DM患者、434例LADA患者与1010例正常对照的IFIH1基因rs1990760多态性进行基因分型。比较T1DM患者、LADA患者与正常对照等位基因与基因型的频率,并分析rs1990760多态性与临床表型、胰岛自身免疫及HLA-DR-DQ基因型的关系。 结果:①IFIH1基因rs1990760多态性等位基因C(79.8%vs.80.7%)与T(20.2% vs.19.3%)在T1DM组与对照中频率差异无显著性。CC(63.1% vs.65.0%), CT(33.5% vs.31.3%)与TT(3.5% vs.3.7%)基因型频率分布在两组间亦无统计学意义(P均>0.05)。②等位基因C与T在LADA组与对照组频率(80.6% vs.80.7%;19.4% vs.19.3%)差异无显著性(P>0.05),CC,CT,TT基因型频率分布在两组间亦无统计学意义(P均>0.05)。③TIDM与LADA患者IFIH1基因rs1990760多态性与起病年龄、体重指数、糖化血红蛋白、胰岛功能及代谢指标等临床特征均无相关性(P均>0.05)。④T1DM患者ZnT8A、GADA与IA-2A的阳性率与滴度在rs1990760多态性CC、CT、TT基因型之间均无显著性差异(P>0.05)。⑤携带易感DQB1*0303等位基因者C等位基因的频率低于非携带者,具有边界性统计学意义(76.76% vs.81.42%,P=0.048)。IFIH1基因rs1990760多态性与HLA-DRB1、DQA1、DQBI高危或低危风险基因型无交互作用(P均>0.05)。 结论:IFIH1基因SNP rs1990760多态性对湖南汉族T1DM与LADA患者无遗传易感作用,与临床特征、胰岛自身免疫及HLA-DR-DQ风险基因均无显著性关联。 第四部分 IFIH1基因rs1990760多态性与1型糖尿病发病风险的Meta分析 目的:综合定量评价IFIH1基因rs1990760多态性与1型糖尿病(T1DM)发病风险的关系。 方法:计算机检索PubMed和Web of Knowledge等数据库,检索时间截至2013年1月1日,提取IFIH1基因rs1990760多态性与T1DM易感性关系的病例-对照研究。以T1DM组与对照组人群等位基因与基因型分布的OR值及其95%CI为效应指标。在加性模型、纯合子模型、显性模型和隐性模型中采用固定或随机效应模型进行Meta分析,并进行发表偏倚评估与敏感性分析。统计分析采用Stata11.0软件。 结果: ①共纳入13个病例对照研究,总计19932例TIDM患者和28606例对照,其中10项研究对象为欧洲血统人群,3项研究对象为亚洲人群。 ②加性模型情况下,IFIH1基因rs1990760多态性等位基因A与T1DM有显著相关性[A vs.G: OR(95%CI)=1.14(1.08~1.22),P=0.000];在显性遗传模型中,AA+AG基因型与T1DM风险有显著相关性[AA+AG vs.GG:OR(95%CI)=1.25(1.16~1.34),P=0.000];在纯合子比较与隐性遗传模型中,AA基因型与T1DM风险有显著相关性[AA vs.GG: OR(95%CI)=1.36(1.26~1.47),P=0.000; AA vs.AG+GG: OR(95%CI)=1.159(1.06~1.27),P=0.001];在杂合子比较中,AG基因型与T1DM风险有显著相关性[AG vs.GG:OR(95%CI)=1.15(1.07~1.24), P=0.000]. ③基于人种的亚组分析显示欧洲血统人群中IFIH1基因rs1990760变异位点的等位基因与基因型在所有遗传模型中均与T1DM有显著相关性[A vs.G:OR(95%CI)=1.18(1.11-1.26),P=0.000];而在亚洲人群中rs1990760变异位点在所有遗传模型中与T1DM发病均无相关性[A vs.G:OR(95%CI)=0.97(0.86-1.08),P=0.921]。 ④发表偏倚评估未见发表偏倚,敏感性分析提示结果比较稳定可靠。 结论:IFIH1基因rs1990760多态性是欧洲血统人群T1DM患者的遗传风险变异,A等位基因携带者增加T1DM易感性,但rs1990760多态性不是亚洲人群T1DM的遗传危险因素。