玉米是重要的粮食、饲料、经济作物,在国民经济中占有重要地位。玉米雄穗是重要的农艺性状,与玉米产量呈负相关。雄穗与雌穗竞争养分,较大雄穗会消耗更多养分,从而降低产量。雄穗分枝数可作为衡量雄穗大小的重要指标,分枝数目越多雄穗越大,养分消耗越多。玉米育种中,选择较小雄穗、较少雄穗分枝数目的品种已成为趋势。因此,研究雄穗分枝数目的遗传模型和遗传机理具有重要意义。本试验选取具有较少雄穗分枝数目玉米自交系3237和玉米自交系1212构建六个世代,分析雄穗分枝数目的遗传模型和遗传效应。六个世代联合分析雄穗分枝数目最优遗传模型为E-3,符合两对加性主基因+加性-显性多基因模型；分离世代B1、B2、F2世代主基因与多基因遗传率之和分别为71.7%、82.9%、62.6%,表明雄穗分枝数目主要受基因控制,环境影响较小,早代选择有效。利用玉米自交系3237和1212组配回交分离群体,构建遗传连锁图谱,进行雄穗分枝数目QTL分析。选取多态性SSR标记114个构建连锁图谱,图谱全长1486.4cM,平均间距13.04cM。结合田间表型值和分子标记,检测雄穗分枝数目QTL位点。BC1群体在云南西双版纳1个环境,BC1S1家系群体分别在云南西双版纳、四川温江2个环境共检测到10个雄穗分枝数目QTL,分布于第2、3、5、7染色体,能够解释的表型贡献率在10.96%-33.18%之间。同一染色体上的QTL位点具有重叠区域,可看作是同一QTL。为雄穗分枝数目QTL精细定位和基因克隆提供了重要参考价值。主效QTL雄穗分枝数目候选基因挖掘。第2染色体上的QTL稳定存在,贡献率较大,在此QTL位点挖掘雄穗分枝数目候选基因。分析得到7个与花发育相关基因,经过比较分析,认为GRMZM2G147241 (G4)基因可能与雄穗分枝发育相关。在不同自交系间克隆测序分析此基因编码区,发现在自交系3237的编码区序列最短。为雄穗分枝数目相关基因挖掘提供了一些参考价值。