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目的:研究ARID1A(AT-rich interactive domain1A)缺失对人胰腺导管上皮细胞(Humanpancreatic catheter epithelial cells,HPNE)恶性转化的具体影响,且深入探讨其抑制胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)发生发展的具体分子机制。
方法:首先利用短发夹RNA(Short hair clip RNA,shRNA)在人胰腺导管上皮细胞中敲减ARID1A的表达,建立稳定转染细胞HPNE/shARID1A及其对照HPNE/Vector。利用KRASG12D质粒在HPNE细胞中构建KRAS突变细胞,并建立稳定转染细胞HPNE/KRASG12D及其对照HPNE/Vector;并利用短发夹RNA(shARID1A)在上述细胞中敲减ARID1A的表达,建立稳定转染细胞HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC。
然后利用软琼脂克隆形成实验和Focus formation assay检测上述细胞模型中ARID1A及协同KRAS突变对人胰腺导管上皮细胞增殖及克隆形成的影响;利用β-半乳糖苷酶染色技术检测它们对细胞衰老影响,利用流式细胞术检测它们对细胞凋亡及周期的影响。蛋白质免疫印迹实验检测两组细胞之间p16和Cyclin D1蛋白的表达情况。
而后在HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC细胞模型中利用转录组高通量测序从中筛选出差异表达的miR-503,利用qPCR检测miR-503在HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC细胞中的表达情况,敲减和过表达miR-503,探讨其功能。
最后利用MicroCosm Targets分析预测miR-503的靶基因,并使用荧光素酶报告分析、蛋白质免疫印迹实验、细胞增殖实验、β-半乳糖苷酶染色(senescence-associatedβ-galactosidaseSA-β-gal)等技术印证和确认该靶基因参与ARID1A对人胰腺导管上皮细胞恶性转化的调控。
结果:在仅敲减ARID1A的HPNE细胞中并无明显集落形成,但是在KRAS突变的HPNE细胞中敲减ARID1A,细胞的增殖能力较仅敲减ARID1A的HPNE细胞明显增高,也远多于单纯HPNE KRAS突变细胞。证明单独的KRAS突变或ARID1A缺失对HPNE细胞的增殖和恶性转化影响不大,但敲减ARID1A协同KRAS突变会促进HPNE细胞的恶性转化。
同时,HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC细胞凋亡能力并无明显改变;但敲减ARID1A后HPNE/KRASG12D的细胞周期明显加快且抑制细胞衰老。此外,ARID1A低表达时衰老相关基因p16显著减少,而细胞周期相关蛋白cyclin D1表达增加。
转录组高通量测序筛选发现当敲减ARID1A时,miR-503的表达明显增高。并且在HPNE/KRASG12D/shARID1A细胞中抑制miR-503的表达时,其克隆形成能力减弱、细胞周期减慢且细胞衰老速度加快;在HPNE/KRASG12D/shNC细胞中过表达miR-503则结果相反。证明敲减ARID1A对HPNE/KRASG12D细胞的相关生物学功能是通过miR-503来实现的。
MicroCosm Targets分析预测miR-503的靶基因为CDKN2A,荧光素酶活性分析发现过表达miR-503明显抑制CDKN2A野生型CDKN2A(WT)的荧光素酶活性,而对于突变型CDKN2A(MT)无影响。且在敲减ARID1A的HPNE/KRASG12D细胞中回转ARID1A,CDKN2A的蛋白表达也相应增高,同时其恶性转化能力降低,而细胞衰老能力有所回复。
结论:本课题发现了ARID1A协同KRAS突变通过细胞衰老途径促进人胰腺导管上皮细胞的恶性转化。而后发现,ARID1A调控人胰腺导管上皮细胞增殖、衰老和细胞周期进程主要是通过miR-503来实现的。进一步证明了ARID1A通过miR-503的下游基因CDKN2A(WT)来实现上述功能的。总而言之,我们的数据有力地阐明了ARID1A抑制人胰腺导管上皮细胞恶性转化的分子机制。
方法:首先利用短发夹RNA(Short hair clip RNA,shRNA)在人胰腺导管上皮细胞中敲减ARID1A的表达,建立稳定转染细胞HPNE/shARID1A及其对照HPNE/Vector。利用KRASG12D质粒在HPNE细胞中构建KRAS突变细胞,并建立稳定转染细胞HPNE/KRASG12D及其对照HPNE/Vector;并利用短发夹RNA(shARID1A)在上述细胞中敲减ARID1A的表达,建立稳定转染细胞HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC。
然后利用软琼脂克隆形成实验和Focus formation assay检测上述细胞模型中ARID1A及协同KRAS突变对人胰腺导管上皮细胞增殖及克隆形成的影响;利用β-半乳糖苷酶染色技术检测它们对细胞衰老影响,利用流式细胞术检测它们对细胞凋亡及周期的影响。蛋白质免疫印迹实验检测两组细胞之间p16和Cyclin D1蛋白的表达情况。
而后在HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC细胞模型中利用转录组高通量测序从中筛选出差异表达的miR-503,利用qPCR检测miR-503在HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC细胞中的表达情况,敲减和过表达miR-503,探讨其功能。
最后利用MicroCosm Targets分析预测miR-503的靶基因,并使用荧光素酶报告分析、蛋白质免疫印迹实验、细胞增殖实验、β-半乳糖苷酶染色(senescence-associatedβ-galactosidaseSA-β-gal)等技术印证和确认该靶基因参与ARID1A对人胰腺导管上皮细胞恶性转化的调控。
结果:在仅敲减ARID1A的HPNE细胞中并无明显集落形成,但是在KRAS突变的HPNE细胞中敲减ARID1A,细胞的增殖能力较仅敲减ARID1A的HPNE细胞明显增高,也远多于单纯HPNE KRAS突变细胞。证明单独的KRAS突变或ARID1A缺失对HPNE细胞的增殖和恶性转化影响不大,但敲减ARID1A协同KRAS突变会促进HPNE细胞的恶性转化。
同时,HPNE/KRASG12D/shARID1A及其对照HPNE/KRASG12D/shNC细胞凋亡能力并无明显改变;但敲减ARID1A后HPNE/KRASG12D的细胞周期明显加快且抑制细胞衰老。此外,ARID1A低表达时衰老相关基因p16显著减少,而细胞周期相关蛋白cyclin D1表达增加。
转录组高通量测序筛选发现当敲减ARID1A时,miR-503的表达明显增高。并且在HPNE/KRASG12D/shARID1A细胞中抑制miR-503的表达时,其克隆形成能力减弱、细胞周期减慢且细胞衰老速度加快;在HPNE/KRASG12D/shNC细胞中过表达miR-503则结果相反。证明敲减ARID1A对HPNE/KRASG12D细胞的相关生物学功能是通过miR-503来实现的。
MicroCosm Targets分析预测miR-503的靶基因为CDKN2A,荧光素酶活性分析发现过表达miR-503明显抑制CDKN2A野生型CDKN2A(WT)的荧光素酶活性,而对于突变型CDKN2A(MT)无影响。且在敲减ARID1A的HPNE/KRASG12D细胞中回转ARID1A,CDKN2A的蛋白表达也相应增高,同时其恶性转化能力降低,而细胞衰老能力有所回复。
结论:本课题发现了ARID1A协同KRAS突变通过细胞衰老途径促进人胰腺导管上皮细胞的恶性转化。而后发现,ARID1A调控人胰腺导管上皮细胞增殖、衰老和细胞周期进程主要是通过miR-503来实现的。进一步证明了ARID1A通过miR-503的下游基因CDKN2A(WT)来实现上述功能的。总而言之,我们的数据有力地阐明了ARID1A抑制人胰腺导管上皮细胞恶性转化的分子机制。