OLR1基因突变与中国荷斯坦牛产奶性能的关联分析

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OLR1基因调控乳腺上皮细胞某些蛋白内化的相关机制和免疫反应,且主要在奶牛乳腺组织表达。为挖掘OLR1基因与奶牛产奶性能的相关关系,本研究以宁夏产区某规模化奶牛场中国荷斯坦牛为研究对象,收集产奶性能测定数据,采用DNA直接测序和PCR-SSCP分型技术对OLR1基因遗传多态性进行检测,并利用SPSS25.0一般线性模型中的单因素方差分析和邓肯法多重比较法探讨OLR1基因突变位点与产奶性状之间的相关性,以期挖掘到真正影响宁夏产区中国荷斯坦牛产奶性状的候选基因及其功能变异位点,为中国荷斯坦牛分子标记辅助选择提供参考依据。主要研究结果如下:1.中国荷斯坦牛OLR1基因CDS编码区全长822 bp,共编码273个氨基酸。OLR1基因编码氨基酸的理论等电点为6.66,不稳定指数为43.05,总平均亲水性为-0.399,说明OLR1蛋白是不稳定蛋白且表现较弱的亲水性,具有一个跨膜结构,定位于细胞质膜,二、三级结构以α-螺旋和无规卷曲为主,属于非分泌蛋白且无信号肽。2.中国荷斯坦牛OLR1基因共筛选出11个突变位点,分别为5’UTR-Exon1区的g.386 A>G转换,产生AA和AB两种基因型,属低度多态(PIC<0.25);Exon5-Intron5区的g.9982 G>T颠换、g.10015 G>A转换、g.10035 G>A转换、g.10063 T>C转换、g.10092 G>C颠换、g.10108G>A转换、g.10166 G>C颠换和g.10227 G>A转换,产生AA、AB、AC和BB四种基因型,属高度多态(PIC>0.5);Exon6-3’UTR区的g.10858 T>G颠换和g.10886 C>A颠换,产生AA、AB和AC三种基因型,属中度多态(0.25<PIC<0.5)。3.OLR1基因突变位点与中国荷斯坦牛产奶性状的关联分析结果及等位基因存在缺失分析结果表明,OLR1基因突变位点与中国荷斯坦牛的部分产奶性状存在显著关联关系。综上,OLR1基因突变位点与中国荷斯坦牛产奶性能的相关分析表明,可将OLR1基因作为影响产奶性状的候选基因,为后续中国荷斯坦牛群体遗传改良提供参考依据。
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