目的:干燥综合征（Sj（?）gren’s syndrome,SS）是一种主要影响外分泌腺的慢性自身免疫性疾病,伴有受累腺体的淋巴细胞浸润,唾液腺和泪腺的受累进一步导致患者口腔和眼睛干燥。到目前为止对于其病因和发病机制的理解还知之甚少,为进一步探究其潜在的致病机理,本研究旨在通过综合的生物信息学分析初探干燥综合征潜在的治疗靶点和分子发病机制。方法:从基因表达综合数据库（GEO）中检索并下载干燥综合征患者的基因表达谱（GSE157159）和DNA甲基化数据集（GSE110007）用于后续的生物信息学数据分析。使用R studio软件中的Limma包鉴定差异表达基因（DEG）和差异甲基化位点（DMP）。通过基因本体论（GO）功能注释以及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析探索差异表达基因的潜在生物学功能。然后使用重叠分析和收缩质心算法筛选出关键差异甲基化位点,并将其所对应的基因确定为枢纽（Hub）基因。接下来,基于Hub基因的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建和单基因基因集富集分析（GSEA）用于揭示Hub基因在分子水平间的相互联系和潜在的病理生理机制。最后,为了进一步验证数据分析的结果,我们从西南医科大学附属医院获取了干燥综合征患者和健康人的全血样本,分离外周血单个核细胞（PBMC）后通过定量实时聚合酶链反应（q RT-PCR）检测Hub基因在人外周血单个核细胞中的表达水平。结果:通过DNA甲基化和转录组分析从两个数据集中总共收获了788个差异甲基化位点和2457个差异表达基因。功能富集分析结果显示差异表达基因在T细胞活化、白细胞-细胞粘附和细胞因子-细胞因子受体相互作用的过程中显著富集。DNA转录起始位点上游的0-200、200-1500个碱基和第一外显子区域是启动子差异甲基化位点胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤（Cp G）岛的高度富集区。对2457个差异表达基因和507个差异甲基化相关基因的重叠共鉴定出61个差异甲基化基因,其中21个基因位于启动子区域。然后,使用收缩质心算法筛选出其中3个关键的差异甲基化位点和其对应的3个Hub基因（RUNX3、HLA-DPA1和CD6）。单基因GSEA分析结果提示这3个Hub基因均与免疫应答过程密切相关。最后,进行q RT-PCR实验初步验证了Hub基因在干燥综合征患者外周血单个核细胞m RNA水平上的阳性表达,这与GSE157159数据集一致,进一步支持了我们的分析结果。结论:综上所述,3个Hub基因在干燥综合征患者外周血单个核细胞中的差异表达可能为理解干燥综合征的分子生物和遗传学机制以及探索全新的靶向药物治疗方法提供新的思考。