昆虫体内通常存在多种微生物，如细菌、病毒、真菌等，长期的进化过程中，昆虫与体内微生物间形成了多种相互关系，有的微生物种类能够影响昆虫的某些重要生命活动过程。棉铃虫Helicoverpa armigera(Hübner)属于鳞翅目夜蛾科，是世界上许多经济作物的重要农业害虫之一，每年造成巨大的经济损失。通过RNA-seq的方法，本研究从棉铃虫体内发现了一种新的感染棉铃虫的病毒，命名为Helicoverpa armigera iflavirus(HaIV)。为了研究HaIV与寄主棉铃虫的相互作用关系，本文对HaIV的分子生物学特征、分子调控机制及生物学功能进行了研究，主要研究结果如下:　　利用蔗糖密度梯度离心法，分离纯化得到HaIV病毒粒体，直径约30nm，通过基因克隆的方法，获得了HaIV的基因组序列，HaIV基因组全长10，017 bp，是单链正义RNA病毒，含有一条长的开放阅读框(ORF)，编码一个由3021个氨基酸组成的多聚蛋白，多聚蛋白的预测分子量为344.16kDa，等电点(pI)为6.45。通过氨基酸序列比对，HaIV与Lymantriadispar iflavirus1(LdIV1)同源性最高，为61.0％，基于依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)序列进行聚类分析表明，HaIV与Iflavirus属的其他成员展现很高的同源性，因此，HaIV是隶属于小RNA病毒目（Picornavirales），传染性软腐病病毒科（Iflaviridae），传染性软腐病病毒属（Iflavirus）的一个新成员。　　利用RNA-seq技术对HaIV侵染48h和72h两个时间点的棉铃虫幼虫进行转录组测序，总共获得了40，299个unigenes，HaIV侵染48h时，共有31584个基因的mRNA水平发生了变化，其中差异表达基因共有367个（占1.16％），上调基因138个，下调基因229个;侵染72h时，共有30457个基因的mRNA水平发生了变化，其中差异表达基因有484个(占1.59％)，上调基因185个，下调基因299个，其中40个基因在两个时间点差异表达。GO功能分类结果表明，细胞组分中以细胞组分和细胞为主，分子功能中以催化活性和结合为主，生物过程中以细胞过程和代谢过程为主。差异基因表达分析表明，HaIV感染后与免疫反应相关的基因（C型凝集素、表皮蛋白）表达量显著下调;1个与产卵量相关的基因（卵黄原蛋白）表达量显著下调。　　HaIV主要分布于棉铃虫成虫和幼虫的脂肪体中，能够经口感染进行水平传播和垂直传播。水平传播效率与病毒浓度有关，当病毒浓度为108 copies/μl时，棉铃虫病毒感染率达到100％,垂直传播效率相对较低，主要通过卵表面进行传播，雌雄虫都感染时，后代感染率为28.57％，且雌虫的垂直传播效率高于雄虫。HaIV感染棉铃虫后，在棉铃虫体内得到复制，随着时间的延长，HaIV拷贝数增加，并在幼虫期达到最高，其后趋于稳定。通过生物测定实验，发现HaIV能延长棉铃虫幼虫和蛹的生长发育时间，提高幼虫死亡率，降低化蛹率，但对蛹死亡率、羽化率和孵化率没有影响。通过棉铃虫田间种群HaIV感染率调查，发现HaIV的田间感染率极低，1188头个体中仅有24头感染，感染率为2.02％。　　当棉铃虫核型多角体病毒(HaNPV)的浓度为1×107和1×108 OBs/ml时，感染HaIV(HaIV+)的棉铃虫幼虫存活率显著高于未感染的HaIV幼虫(HaIV-)，当HaNPV浓度为1×109OBs/ml时，HaIV+幼虫存活率与HaIV-无显著差异，但HaIV+幼虫体内HaNPV拷贝数显著低于HaIV-，表明HaIV可能通过抑制HaNPV的复制，对棉铃虫幼虫起到一定的保护作用;随着时间的延长，棉铃虫幼虫平均发育得分增加，而随着Bt浓度的增加，棉铃虫幼虫平均发育得分降低，在不同Bt浓度下，HaIV+的幼虫平均发育级别均低于HaIV-，随着Bt浓度的增加，这一差异逐渐缩小，表明在高浓度Bt作用下，棉铃虫幼虫发育速率不受HaIV感染状态的影响;棉铃虫同时感染HaIV和HaDV2（棉铃虫浓核病毒）两种病毒时，幼虫和蛹生长发育时间显著延长，蛹死亡率和羽化率显著降低，幼虫死亡率和化蛹率与对照无差异。　　综上所述，本研究在棉铃虫体内发现了一个新的RNA病毒HaIV，与Iflavirus属的成员具有较高的同源性，但具有一些新的特征，因此是Iflavirus属的一个新成员。HaIV感染棉铃虫后，诱导了与免疫相关的表皮蛋白基因显著下调。HaIV主要分布在棉铃虫成虫和幼虫的脂肪体中，能通过水平和垂直两种方式进行传播，但田间感染率很低。HaIV能延长棉铃虫生长发育时间，提高幼虫死亡率和对HaNPV的抗性。研究病毒与昆虫的相互关系是解析寄主昆虫适应性的重要基础，有助于为害虫防治提供新思路。