跨国公司是世界经济的重要组成部分，R&D部门是跨国公司最重要的部门之一，是世界知识创新的重要诞生地。作为一种新的生产力，跨国公司R&D部门的全球化过程受到世界范围的广泛关注。我国作为目前世界上吸引FDI和R&D最多的国家之一，在跨国公司R&D全球化过程中成为重要的节点。据商务部2007年统计，跨国公司在我国的R&D投资接近一千家，而北京、上海作为我们国家最重要的两个城市，吸引了近跨国公司80％的R&D投资在这两个城市。另据世界贸发组织(UNCTAD)《2005年世界投资报告》预测2005-2009年我国将成为世界上跨国公司R&D投资最具吸引力的国家，有61.8％的企业已经或将要在这期间对我国进行投资，而排在第二位和第三位的美国和印度仅为41.2％和29.4％。北京、上海将在这个过程中将会继续扮演重要角色，因此对北京上海在吸引跨国公司R&D投资的区位比较研究具有重要的现实意义。 跨国公司在我国的R&D投资始于20世纪90年代，加拿大北方电讯公司与北京邮电大学合作成立的北方电讯研发中心拉开了跨国公司R&D在我国投资的序幕。在投资的初级阶段，首都区位让北京占据了绝对优势，在最初投资我国的跨国公司R&D中北京占到了50％左右，而上海作为吸引R&D投资的第二大城市，数量仅为北京的一半。随着跨国公司R&D在我国的不断发展，对我国的国情不断熟悉，上海在市场、环境、政府管理能力等方面的优势逐渐体现出来，在数量上开始赶超北京。此外，从跨国公司R&D投资的级别来看，上海也逐渐占据优势，跨国公司纷纷在上海成立全球性研发中心，而且这种趋势在明显加强。由于现阶段上海在创新体系的市场化运作方面的优势，上海在吸收跨国公司R&D中仍将保持强劲势头，但北京由于其文化中心的地位以及高校、科研院所云集，随着我国体制的不断改革和科研水平的不断提高，其优势将会显现出来。目前投资北京的跨国公司R&D主要集中在ICT行业，上海则表现出兼收并蓄的发展特点，ICT、化工、汽车、机械、生物医药等领域均蓬勃发展。北京、上海所在的区域在吸引跨国公司R&D中所起的作用不同，环渤海经济圈目前经济水平较长三角经济圈低，区域合作不充分，这也是的北京及其所在区域在吸引跨国公司R&D的速度减缓，而上海及其腹地则呈现出快速发展态势。