《明史·河渠志》的“海运”部分是全面、系统记载有明一代海运史事的专篇文献,是今人了解和研究明代海运最为易得、常用因而影响也最大的主要史料之一,但其中也有不少史事缺漏、记载欠明甚至史实讹误之处。长期以来,由于史学界对其缺乏足够的研究,致使这些问题不仅影响了其积极作用的发挥,而且还给研究者造成了诸多误导。据《明实录》、《明会典》、丘濬《漕挽之宜》、王以旂《王襄敏公集》、王宗沐《海运详考》、梁梦龙《海运新考》等,从以下三个方面对其进行全面考证:第一,补缺,针对其缺载或语焉不详之处,查找史料,补其缺略、明其原委,旨在尽可能恢复和理清明代海运发展的基本史事线索。第二、纠谬,对其提法不准确甚至讹误之处,进行考证、纠谬,旨在澄清史实。第三是对其涉及的每一制度和事件,努力论其得失、明其意义,旨在进一步深化和丰富对明代海运发展及其利弊得失和经验教训的认识,以为现实提供有益的借鉴。